59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1880 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  57.01 
 
 		 673 aa  811    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  57.72 
 
 		 669 aa  798    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 722 aa  1491    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2205  cytochrome c class I  51.5 
 
 		 656 aa  526  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6271  cytochrome c class I  53.39 
 
 		 663 aa  528  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000987167  normal  0.709184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4773  cytochrome c class I  50 
 
 		 669 aa  527  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3236  cytochrome c class I  50.56 
 
 		 647 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0631004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1580  large, multifunctional secreted protein  43.19 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.10938  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1439  hypothetical protein  38.56 
 
 		 509 aa  345  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.421301  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0336  hypothetical protein  35.24 
 
 		 502 aa  296  7e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1171  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.08 
 
 		 491 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5004  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1010 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5289  cytochrome c class I  26.21 
 
 		 920 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  43.24 
 
 		 1171 aa  99.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.33 
 
 		 1265 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  39.32 
 
 		 373 aa  96.3  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  42.48 
 
 		 1274 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  38.33 
 
 		 1390 aa  91.3  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  34.38 
 
 		 358 aa  90.5  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.04 
 
 		 1306 aa  89.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.63 
 
 		 1180 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  37.17 
 
 		 147 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  30.43 
 
 		 161 aa  72.4  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  28.73 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  32.48 
 
 		 165 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.61 
 
 		 448 aa  55.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  33.33 
 
 		 150 aa  54.7  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  30.25 
 
 		 287 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  28.12 
 
 		 160 aa  51.2  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  33.91 
 
 		 150 aa  51.2  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  31.58 
 
 		 159 aa  51.2  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  31.4 
 
 		 164 aa  50.8  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  31.58 
 
 		 159 aa  50.8  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  26.77 
 
 		 396 aa  49.7  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  25.86 
 
 		 173 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3289  azurin  27.05 
 
 		 149 aa  48.1  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.949678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  27.56 
 
 		 241 aa  47.4  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  25.4 
 
 		 164 aa  47.4  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  24.23 
 
 		 379 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.07 
 
 		 1149 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  38.04 
 
 		 424 aa  47  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  24.49 
 
 		 430 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  23.81 
 
 		 430 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  23.81 
 
 		 430 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  28.85 
 
 		 448 aa  45.8  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  23.81 
 
 		 430 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  33.33 
 
 		 148 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  24.11 
 
 		 381 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0280  blue (type 1) copper domain protein  26.14 
 
 		 188 aa  45.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  21.77 
 
 		 390 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  25.56 
 
 		 514 aa  45.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  28.74 
 
 		 136 aa  45.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  25.41 
 
 		 160 aa  44.7  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  21.77 
 
 		 390 aa  44.7  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01601  azurin precursor  32.22 
 
 		 149 aa  44.3  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21134  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  29.73 
 
 		 155 aa  44.3  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  25.62 
 
 		 160 aa  44.3  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  21.43 
 
 		 390 aa  43.9  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  21.43 
 
 		 390 aa  43.9  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>