49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1808 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  100 
 
 		 348 aa  711    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  58.41 
 
 		 1251 aa  398  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  58.84 
 
 		 378 aa  395  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  57.02 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  51.14 
 
 		 381 aa  356  2.9999999999999997e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01621  BNR/Asp-box repeat domain protein  53.75 
 
 		 350 aa  335  5.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7180  putative neuraminidase  48.7 
 
 		 370 aa  311  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.832478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4268  hypothetical protein  42.15 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2045  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  41.36 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  37.25 
 
 		 371 aa  209  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3918  hypothetical protein  38.66 
 
 		 350 aa  186  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  37.57 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  39.29 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1356  putative cytoplasmic protein  37.39 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0360732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1929  putative cytoplasmic protein  37.68 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.733619  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0562  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270788  normal  0.469707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1043  hypothetical protein  32.12 
 
 		 414 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6297  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.92 
 
 		 395 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.715127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1532  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.92 
 
 		 395 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6956  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.36 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5961  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.08 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02900  conserved hypothetical protein  32.07 
 
 		 372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  30.57 
 
 		 413 aa  126  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8131  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.13 
 
 		 398 aa  125  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3540  hypothetical protein  29.49 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  30.6 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3711  hypothetical protein  29.22 
 
 		 395 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6450  putative glycosyl hydrolase protein  27.89 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6273  putative glycosyl hydrolase protein  27.82 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  29.16 
 
 		 393 aa  109  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1246  BNR/Asp-box repeat-containing protein  30.15 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3984  hypothetical protein  27.84 
 
 		 398 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1110  BNR/Asp-box repeat protein  27.78 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3075  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.61 
 
 		 461 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0557  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.87 
 
 		 375 aa  86.7  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.560584 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07930  conserved hypothetical protein  28.32 
 
 		 333 aa  86.7  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0061  hypothetical protein  26.52 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1897  BNR/Asp-box repeat protein  27.22 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.417517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3508  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.94 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  25.97 
 
 		 823 aa  67.4  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3583  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.31 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.436734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  28.57 
 
 		 583 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.632937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1324  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.58 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.12068  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4196  hypothetical protein  26.09 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0677  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.49 
 
 		 417 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0743281  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 1044 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2315  hypothetical protein  27.89 
 
 		 392 aa  43.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0204417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>