53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1495 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
255 aa  528  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  34.65 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  32.17 
 
 
253 aa  132  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  29.95 
 
 
254 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  36.28 
 
 
287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  32.03 
 
 
288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  32.89 
 
 
288 aa  115  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  32.24 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  28.19 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  30.29 
 
 
276 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  27.73 
 
 
247 aa  105  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  31.75 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  34.17 
 
 
155 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  30.66 
 
 
157 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  35.54 
 
 
127 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  30.95 
 
 
157 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  30.95 
 
 
157 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  30.95 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  36.97 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  28.24 
 
 
174 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  30.95 
 
 
151 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  28.24 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  29.23 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  28.24 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  29.37 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  27.82 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  30.08 
 
 
160 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3812  putative lipoprotein  22.86 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  32.28 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  30.3 
 
 
158 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  30.3 
 
 
158 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  30.97 
 
 
164 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  30.3 
 
 
158 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  31.2 
 
 
125 aa  61.6  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  28.79 
 
 
158 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  33.08 
 
 
130 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  28.46 
 
 
141 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2420  hypothetical protein  26.98 
 
 
222 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  29.71 
 
 
150 aa  53.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  29.66 
 
 
170 aa  52.8  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  29.73 
 
 
156 aa  52.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  31.58 
 
 
155 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  27.27 
 
 
135 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  27.73 
 
 
131 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5315  hypothetical protein  26.72 
 
 
139 aa  49.3  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  35.23 
 
 
186 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  24.8 
 
 
138 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  26.02 
 
 
139 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5910  hypothetical protein  27.37 
 
 
162 aa  42.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5221  hypothetical protein  25.58 
 
 
173 aa  42.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  29.36 
 
 
185 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  28.1 
 
 
138 aa  42.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>