More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0881 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0881  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 122 aa  247  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0879  transcriptional regulator, HxlR family  89.74 
 
 		 119 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.399174  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3848  HxlR family transcriptional regulator  83.02 
 
 		 121 aa  188  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2633  transcriptional regulator, HxlR family  75.83 
 
 		 121 aa  184  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895266  normal  0.749568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4237  transcriptional regulator, HxlR family  71.68 
 
 		 125 aa  171  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.940949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4263  transcriptional regulator, HxlR family  55.17 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.042978  normal  0.290046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  55.24 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5687  transcriptional regulator, HxlR family  50.88 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.643264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2531  transcriptional regulator, HxlR family  48.62 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6703  transcriptional regulator, HxlR family  40.5 
 
 		 133 aa  98.6  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  42.99 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  42.99 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  42.99 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  42.99 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  42.99 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  42.99 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  42.99 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  42.99 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  42.99 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  45.1 
 
 		 116 aa  94.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 		 118 aa  94.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 		 117 aa  92  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  39 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  42.27 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  43 
 
 		 116 aa  89.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 111 aa  87.4  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  34.23 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 127 aa  87  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  42.39 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  42.42 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  37.84 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  41.28 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  37.38 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 121 aa  84.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 125 aa  84.7  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 159 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  40.4 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0240  helix-turn-helix HxlR type  41 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.566878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  38.68 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  38.26 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1782  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0168  helix-turn-helix HxlR type  41 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  44.44 
 
 		 114 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7105  transcriptional regulator protein-like protein  39.39 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248427  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  39.22 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  39.22 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  39.22 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  39.22 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  43.33 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  39.22 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  36.46 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  39.22 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  37.37 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  39.81 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  43.69 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  37 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  42.22 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  41.76 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  41.76 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  42.22 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  35.2 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  43.64 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  43.33 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  35.42 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2490  transcriptional regulator  45.74 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  42.35 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  43.33 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  38.95 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  38.83 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>