More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0501 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0501  Exodeoxyribonuclease VII  100 
 
 
404 aa  833    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3317  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.36 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7199  Exodeoxyribonuclease VII  42.16 
 
 
475 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2199  Exodeoxyribonuclease VII  32.66 
 
 
464 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.503662  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3775  exodeoxyribonuclease VII  40.12 
 
 
478 aa  240  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1128  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.86 
 
 
460 aa  190  5e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0236  Exodeoxyribonuclease VII  32.2 
 
 
526 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1091  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.41 
 
 
514 aa  133  6e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0178  exodeoxyribonuclease VII  30.58 
 
 
526 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106589  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1369  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.79 
 
 
508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0465393 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1291  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.59 
 
 
516 aa  127  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00804407  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1209  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.55 
 
 
522 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000650219  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4878  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.1 
 
 
576 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.983312 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1761  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.29 
 
 
455 aa  123  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1869  exodeoxyribonuclease VII  26.84 
 
 
530 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.205151  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0198  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.41 
 
 
555 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0148  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.93 
 
 
413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214735  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0368  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.06 
 
 
450 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313066 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3117  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.63 
 
 
424 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000975107  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28 
 
 
384 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0321  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.12 
 
 
407 aa  94.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.568977  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.08 
 
 
397 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.3 
 
 
511 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286827 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  24.15 
 
 
405 aa  93.2  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1979  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  22.52 
 
 
414 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337025  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4728  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.42 
 
 
392 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2324  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.46 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.975786  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1460  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.79 
 
 
386 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  25.41 
 
 
452 aa  90.9  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.19 
 
 
400 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.72 
 
 
445 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2647  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.17 
 
 
466 aa  87.8  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.66 
 
 
396 aa  87.4  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0367  exonuclease VII, large subunit  30.52 
 
 
387 aa  87  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.34 
 
 
448 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.34 
 
 
448 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.34 
 
 
448 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1916  exodeoxyribonuclease VII  33.13 
 
 
478 aa  86.3  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0537886  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1093  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25 
 
 
474 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18484  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.81 
 
 
400 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1008  exonuclease VII large subunit  32.43 
 
 
467 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596723  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1722  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.13 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.209021  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.2 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.29 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000320124  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02381  exonuclease VII, large subunit  31.68 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1893  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.58 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.185054 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1296  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.67 
 
 
442 aa  84  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430502  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.51 
 
 
393 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30 
 
 
448 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1865  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.17 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.862893 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1002  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  20.98 
 
 
454 aa  83.6  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000181465  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1378  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.82 
 
 
448 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  22.19 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1233  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30 
 
 
448 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1304  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30 
 
 
448 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566056  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.06 
 
 
445 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  21.53 
 
 
414 aa  82.8  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.18 
 
 
398 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.24 
 
 
458 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20410  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.41 
 
 
413 aa  82  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.586183  normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3573  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.05 
 
 
445 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.168579  hitchhiker  0.00774159 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.21 
 
 
443 aa  82  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.76 
 
 
402 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2759  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.57 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.340088  normal  0.610939 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.61 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.96 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.2 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000016399  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1309  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.1 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2567  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.19 
 
 
436 aa  80.1  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00271156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2644  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.1 
 
 
436 aa  79.7  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.603733  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01621  exonuclease VII, large subunit  29.82 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381719  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  21.29 
 
 
414 aa  79.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.6 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0262  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.47 
 
 
427 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1558  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.12 
 
 
442 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0686099  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1037  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.91 
 
 
397 aa  79.7  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0524439  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01051  exodeoxyribonuclease VII  26.1 
 
 
382 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125237  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6807  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.48 
 
 
501 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0976698  normal  0.286525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2482  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.05 
 
 
447 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.780603  normal  0.458338 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3125  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.63 
 
 
442 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284972  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0315  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.14 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1221  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.05 
 
 
542 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1153  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.05 
 
 
542 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.51 
 
 
453 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1136  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.92 
 
 
450 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000110023  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1415  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.01 
 
 
494 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0998332  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2037  exodeoxyribonuclease VII large subunit  21.94 
 
 
465 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0939  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.16 
 
 
456 aa  77  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0421457  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.75 
 
 
408 aa  77  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2553  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.85 
 
 
541 aa  77  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.30129  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2064  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.47 
 
 
403 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0620  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.97 
 
 
477 aa  76.6  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419722  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1184  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.6 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.389235  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1132  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.45 
 
 
483 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692394  normal  0.0141184 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1056  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.52 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2078  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.43 
 
 
402 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1056  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.52 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3498  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.19 
 
 
526 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.48 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2360  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.39 
 
 
447 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.203365  normal  0.598645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>