More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0148 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0148  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
413 aa  812    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214735  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1209  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.67 
 
 
522 aa  244  3e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000650219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0198  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.12 
 
 
555 aa  224  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1369  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.89 
 
 
508 aa  219  7.999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0465393 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1091  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.56 
 
 
514 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4878  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.76 
 
 
576 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.983312 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1291  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.11 
 
 
516 aa  210  4e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00804407  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1128  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.4 
 
 
460 aa  169  7e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0236  Exodeoxyribonuclease VII  31.23 
 
 
526 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0178  exodeoxyribonuclease VII  29.82 
 
 
526 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106589  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1869  exodeoxyribonuclease VII  28.91 
 
 
530 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.205151  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2199  Exodeoxyribonuclease VII  32.63 
 
 
464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.503662  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7199  Exodeoxyribonuclease VII  29.13 
 
 
475 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3775  exodeoxyribonuclease VII  31.02 
 
 
478 aa  123  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0501  Exodeoxyribonuclease VII  28.93 
 
 
404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3117  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.61 
 
 
424 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000975107  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0262  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.99 
 
 
427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.84 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4570  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.78 
 
 
384 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3317  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.63 
 
 
387 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.68 
 
 
396 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1777  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.04 
 
 
428 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8482  Exodeoxyribonuclease VII  28.57 
 
 
402 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.66 
 
 
397 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.41 
 
 
476 aa  103  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2324  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.02 
 
 
399 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.975786  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1309  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.41 
 
 
398 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02381  exonuclease VII, large subunit  27.09 
 
 
385 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1188  Exodeoxyribonuclease VII  33.67 
 
 
529 aa  100  6e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0154172  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.23 
 
 
402 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0127  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.85 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40242  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0368  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.34 
 
 
450 aa  98.6  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0846  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.44 
 
 
401 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.58 
 
 
422 aa  97.8  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000320124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6807  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.52 
 
 
501 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0976698  normal  0.286525 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2550  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.96 
 
 
448 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306428 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0468  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.06 
 
 
406 aa  95.5  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.37 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.65 
 
 
406 aa  94.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.57 
 
 
414 aa  94.4  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.57 
 
 
414 aa  93.6  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.6 
 
 
459 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8274  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.58 
 
 
422 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3880  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.97 
 
 
416 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22970  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.37 
 
 
479 aa  92.8  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.776819  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.54 
 
 
402 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1093  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.85 
 
 
474 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18484  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1761  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.3 
 
 
455 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.03 
 
 
445 aa  90.9  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  22.65 
 
 
404 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1101  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.56 
 
 
432 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1006  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.19 
 
 
406 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795132  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1893  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.61 
 
 
424 aa  90.9  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.185054 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.99 
 
 
402 aa  90.1  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0029  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.19 
 
 
388 aa  89.7  8e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0282686  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.47 
 
 
427 aa  89.7  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.618779  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1153  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.5 
 
 
542 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1221  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.5 
 
 
542 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0529  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.89 
 
 
419 aa  89  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0878  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.82 
 
 
417 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1928  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.57 
 
 
452 aa  89.4  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1926  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30 
 
 
439 aa  88.6  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0056  putative exodeoxyribonuclease VII, large subunit  22.7 
 
 
388 aa  88.2  3e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1296  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.54 
 
 
442 aa  87.8  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430502  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.23 
 
 
511 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.85 
 
 
463 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0939  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.65 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.14 
 
 
463 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.14 
 
 
463 aa  87  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.88 
 
 
406 aa  86.7  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1722  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.97 
 
 
459 aa  86.7  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.209021  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  26.55 
 
 
405 aa  86.7  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0539  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.87 
 
 
459 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  21.3 
 
 
407 aa  86.3  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000325061  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1017  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.19 
 
 
398 aa  86.3  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01051  exodeoxyribonuclease VII  23.83 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125237  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2302  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.41 
 
 
445 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1557  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.72 
 
 
445 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2006  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.4 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1460  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.86 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.84 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.36 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1074  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.39 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2085  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.4 
 
 
465 aa  84.3  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0641  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.49 
 
 
449 aa  84.7  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.782635  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0367  exonuclease VII, large subunit  26.77 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0315  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.24 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.31 
 
 
455 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.12 
 
 
460 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144595  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2462  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.12 
 
 
460 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422545 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4244  exodeoxyribonuclease VII large subunit  20.56 
 
 
444 aa  84  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.36 
 
 
458 aa  84  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000130865  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0746  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.77 
 
 
467 aa  83.6  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1979  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.57 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337025  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0429  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.96 
 
 
491 aa  83.2  0.000000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000348661 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20410  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.27 
 
 
413 aa  82.8  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.586183  normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.36 
 
 
443 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.61 
 
 
453 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1136  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.64 
 
 
450 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000110023  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3125  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.93 
 
 
442 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284972  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>