More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1865 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1865  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
411 aa  843    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.862893 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2064  exodeoxyribonuclease VII large subunit  64.82 
 
 
403 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2037  exodeoxyribonuclease VII large subunit  58.52 
 
 
465 aa  474  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2078  exodeoxyribonuclease VII large subunit  60.31 
 
 
402 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2413  exodeoxyribonuclease VII large subunit  57.44 
 
 
402 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0340  exodeoxyribonuclease VII large subunit  56.31 
 
 
402 aa  434  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.194852 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0321  exodeoxyribonuclease VII large subunit  56.1 
 
 
407 aa  411  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.568977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.33 
 
 
453 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.51 
 
 
398 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.72 
 
 
406 aa  275  8e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.36 
 
 
448 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.85 
 
 
404 aa  272  7e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.71 
 
 
453 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.39 
 
 
458 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.79 
 
 
475 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.17 
 
 
458 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.96 
 
 
423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1761  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.82 
 
 
455 aa  265  8e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.21 
 
 
396 aa  265  8e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0681  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.36 
 
 
416 aa  264  2e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.33 
 
 
405 aa  263  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.33 
 
 
475 aa  263  6e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.07 
 
 
407 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1603  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.76 
 
 
410 aa  260  3e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.06 
 
 
393 aa  260  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.05 
 
 
400 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.59 
 
 
393 aa  259  7e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.5 
 
 
407 aa  258  9e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.58 
 
 
449 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.58 
 
 
449 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.58 
 
 
449 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0430  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.84 
 
 
414 aa  258  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3498  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.65 
 
 
526 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  47.67 
 
 
452 aa  257  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3174  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.87 
 
 
541 aa  257  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.515348  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.29 
 
 
449 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1216  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.21 
 
 
448 aa  256  4e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0401789  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.35 
 
 
451 aa  256  6e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1695  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.36 
 
 
536 aa  255  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85082 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.82 
 
 
414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.29 
 
 
449 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.52 
 
 
400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.45 
 
 
458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.82 
 
 
414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2514  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.01 
 
 
401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1352  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50 
 
 
537 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60305  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1238  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  48.4 
 
 
549 aa  254  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122237  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.62 
 
 
411 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2553  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.15 
 
 
541 aa  252  7e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.30129  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0952  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.46 
 
 
496 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4728  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.45 
 
 
392 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.01 
 
 
400 aa  252  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.35 
 
 
452 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3734  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.01 
 
 
456 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000326312  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.65 
 
 
457 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1753  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.53 
 
 
407 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.198539 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.01 
 
 
456 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.01 
 
 
456 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000149221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  46.01 
 
 
456 aa  250  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000102008  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1767  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.16 
 
 
447 aa  250  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00135793  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  46.01 
 
 
456 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000142965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.01 
 
 
456 aa  250  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.39 
 
 
456 aa  250  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.01 
 
 
456 aa  250  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1890  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.79 
 
 
446 aa  250  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101941  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4330  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.3 
 
 
548 aa  249  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554584  normal  0.651535 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.47 
 
 
422 aa  249  6e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000320124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.06 
 
 
452 aa  249  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.06 
 
 
452 aa  249  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.06 
 
 
452 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6068  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.6 
 
 
507 aa  249  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0339601  normal  0.285374 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.06 
 
 
452 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.06 
 
 
452 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.85 
 
 
463 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.65 
 
 
452 aa  248  9e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4621  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.93 
 
 
541 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.06 
 
 
452 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.06 
 
 
452 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.21 
 
 
454 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0029  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.31 
 
 
388 aa  248  1e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0282686  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.65 
 
 
452 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0605  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.43 
 
 
516 aa  248  2e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.38 
 
 
465 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1859  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.93 
 
 
538 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.020819 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.06 
 
 
476 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.29 
 
 
455 aa  246  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.08 
 
 
459 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.07 
 
 
402 aa  246  6e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.34 
 
 
536 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4549  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.31 
 
 
526 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4284  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.31 
 
 
527 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671183  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.57 
 
 
445 aa  246  6.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0056  putative exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.34 
 
 
388 aa  246  6.999999999999999e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0620  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.78 
 
 
477 aa  246  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419722  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.09 
 
 
455 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1293  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.87 
 
 
387 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.25 
 
 
463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.59 
 
 
446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  46.51 
 
 
448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.97 
 
 
519 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.726437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>