More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4330 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3873  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  90.23 
 
 
522 aa  820    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633021  normal  0.0839806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4183  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  90.44 
 
 
523 aa  822    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4330  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  100 
 
 
548 aa  1054    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554584  normal  0.651535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0667  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  68.32 
 
 
566 aa  647    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6068  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  68.17 
 
 
507 aa  616  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0339601  normal  0.285374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6605  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  64.8 
 
 
531 aa  609  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1413  exodeoxyribonuclease VII large subunit  63.72 
 
 
496 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2553  exodeoxyribonuclease VII large subunit  54.93 
 
 
541 aa  512  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.30129  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1352  exodeoxyribonuclease VII large subunit  54.96 
 
 
537 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60305  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0620  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  60.04 
 
 
477 aa  514  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419722  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3174  exodeoxyribonuclease VII large subunit  54.2 
 
 
541 aa  513  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.515348  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1238  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  56.62 
 
 
549 aa  508  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122237  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3498  exodeoxyribonuclease VII large subunit  54.21 
 
 
526 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4621  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.15 
 
 
541 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4284  exodeoxyribonuclease VII large subunit  54.12 
 
 
527 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671183  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.84 
 
 
536 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4549  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.56 
 
 
526 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1695  exodeoxyribonuclease VII large subunit  56.05 
 
 
536 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1859  exodeoxyribonuclease VII large subunit  55.31 
 
 
538 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.020819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0398  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  56.47 
 
 
521 aa  476  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.636778 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2996  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.21 
 
 
527 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.5 
 
 
543 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.958847  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0764  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.97 
 
 
511 aa  449  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130053  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0182  exodeoxyribonuclease VII large subunit  54.89 
 
 
519 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0628  exodeoxyribonuclease VII large subunit  58.65 
 
 
485 aa  449  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.088972 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0712  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.97 
 
 
511 aa  450  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1034  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.21 
 
 
476 aa  432  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.31032  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0634  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.54 
 
 
519 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1945  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.22 
 
 
502 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0494  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.87 
 
 
519 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3300  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50 
 
 
519 aa  425  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1845  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.68 
 
 
519 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.264563  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.3 
 
 
519 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.67 
 
 
475 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3148  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.93 
 
 
492 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0159  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.89 
 
 
537 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1226  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.79 
 
 
528 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.901078  normal  0.0774047 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2727  exodeoxyribonuclease 7 large subunit  50.5 
 
 
523 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0564335  normal  0.143765 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0171  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.86 
 
 
453 aa  385  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1331  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.9 
 
 
462 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.701446  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2864  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  49.68 
 
 
486 aa  330  5.0000000000000004e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265405  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.67 
 
 
458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.89 
 
 
458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41 
 
 
453 aa  299  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0029  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.55 
 
 
388 aa  288  1e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0282686  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0056  putative exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.53 
 
 
388 aa  286  7e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.71 
 
 
476 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1890  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.91 
 
 
446 aa  282  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101941  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.45 
 
 
463 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.69 
 
 
475 aa  279  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.73 
 
 
453 aa  277  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.45 
 
 
463 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.68 
 
 
459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.07 
 
 
463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.86 
 
 
463 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.27 
 
 
448 aa  272  9e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.47 
 
 
446 aa  272  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.23 
 
 
463 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.04 
 
 
455 aa  270  5.9999999999999995e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.1 
 
 
454 aa  269  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.73 
 
 
459 aa  269  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.14 
 
 
411 aa  263  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.71 
 
 
404 aa  263  8.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.78 
 
 
451 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.19 
 
 
457 aa  260  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.68 
 
 
469 aa  260  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1767  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.08 
 
 
447 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00135793  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.64 
 
 
449 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.64 
 
 
449 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.41 
 
 
449 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2078  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.86 
 
 
402 aa  256  8e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1339  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.09 
 
 
462 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.18 
 
 
443 aa  254  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.62 
 
 
452 aa  254  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.62 
 
 
452 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1670  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.82 
 
 
401 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.62 
 
 
452 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1719  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37 
 
 
454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.623668  hitchhiker  0.0000296907 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.41 
 
 
449 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.28 
 
 
406 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.96 
 
 
456 aa  253  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.14 
 
 
452 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.14 
 
 
452 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.14 
 
 
452 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.14 
 
 
452 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.14 
 
 
452 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.44 
 
 
451 aa  252  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1865  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.07 
 
 
411 aa  251  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.862893 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.94 
 
 
449 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1052  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.55 
 
 
448 aa  251  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.9 
 
 
452 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.9 
 
 
452 aa  251  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.87 
 
 
461 aa  251  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2413  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.36 
 
 
402 aa  249  6e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.16 
 
 
455 aa  249  7e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.53 
 
 
448 aa  249  8e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.16 
 
 
448 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.41 
 
 
447 aa  249  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15230  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.33 
 
 
459 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173867  hitchhiker  0.000000000874033 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.86 
 
 
393 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>