More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2730 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  70.89 
 
 
456 aa  660    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000149221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  70.89 
 
 
456 aa  660    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000102008  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1301  exodeoxyribonuclease VII large subunit  73.86 
 
 
459 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000114365  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  71.33 
 
 
456 aa  663    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  70.24 
 
 
455 aa  664    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0410  exodeoxyribonuclease VII large subunit  73.86 
 
 
459 aa  649    Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000134785  hitchhiker  0.000369784 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  70.89 
 
 
456 aa  660    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000142965  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  71.75 
 
 
449 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3734  exodeoxyribonuclease VII large subunit  70.89 
 
 
456 aa  648    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000326312  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1193  exodeoxyribonuclease VII large subunit  73.86 
 
 
458 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.10806e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  71.75 
 
 
449 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  75.93 
 
 
458 aa  686    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000130865  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  71.11 
 
 
456 aa  665    Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  71.11 
 
 
456 aa  665    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  71.53 
 
 
449 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  68.11 
 
 
457 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  79.57 
 
 
462 aa  726    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  82.61 
 
 
461 aa  771    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  78.91 
 
 
464 aa  719    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
465 aa  936    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  71.75 
 
 
449 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  71.53 
 
 
449 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  58.85 
 
 
443 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  58.62 
 
 
443 aa  514  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  56.45 
 
 
444 aa  505  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  57.92 
 
 
446 aa  501  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1216  exodeoxyribonuclease VII large subunit  58.12 
 
 
448 aa  489  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0401789  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.51 
 
 
446 aa  476  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000016399  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.15 
 
 
445 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.92 
 
 
448 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.5 
 
 
448 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1233  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.37 
 
 
448 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1304  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.69 
 
 
448 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566056  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.93 
 
 
445 aa  461  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.27 
 
 
448 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2647  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.73 
 
 
466 aa  464  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1378  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.27 
 
 
448 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.05 
 
 
448 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1558  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.57 
 
 
442 aa  455  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0686099  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  51.37 
 
 
450 aa  458  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2360  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.7 
 
 
447 aa  458  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.203365  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1296  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.36 
 
 
442 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430502  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3125  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.68 
 
 
442 aa  451  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284972  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1136  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.49 
 
 
450 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000110023  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2951  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.92 
 
 
447 aa  438  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19698  normal  0.152138 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4244  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.32 
 
 
444 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3121  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  49.66 
 
 
444 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698852  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.77 
 
 
454 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.73 
 
 
451 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.99 
 
 
458 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  46.7 
 
 
467 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  45.85 
 
 
446 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  46.98 
 
 
458 aa  386  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.92 
 
 
475 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1034  Exodeoxyribonuclease VII  52.1 
 
 
447 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.38 
 
 
447 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.39 
 
 
476 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.56 
 
 
414 aa  371  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.32 
 
 
453 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  45.33 
 
 
414 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.62 
 
 
463 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1890  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.22 
 
 
446 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101941  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  46.49 
 
 
452 aa  361  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.48 
 
 
463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.62 
 
 
456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.79 
 
 
453 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3218  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.22 
 
 
457 aa  355  7.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  47.25 
 
 
463 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.79 
 
 
459 aa  355  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.94 
 
 
459 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.17 
 
 
463 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.6 
 
 
445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.29 
 
 
454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.94 
 
 
463 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2759  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.21 
 
 
443 aa  346  6e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.340088  normal  0.610939 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.16 
 
 
448 aa  345  8e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.37 
 
 
451 aa  344  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1339  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.48 
 
 
462 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.69 
 
 
448 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0888  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.27 
 
 
443 aa  343  4e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.16 
 
 
452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.16 
 
 
452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.16 
 
 
452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.16 
 
 
452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.16 
 
 
452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15230  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.02 
 
 
459 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173867  hitchhiker  0.000000000874033 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1767  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.82 
 
 
447 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00135793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.94 
 
 
452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0857  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.05 
 
 
443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.16 
 
 
452 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.94 
 
 
452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.16 
 
 
452 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.82 
 
 
458 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0539  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.18 
 
 
459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.82 
 
 
458 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.05 
 
 
460 aa  336  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782017  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.51 
 
 
455 aa  333  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.32 
 
 
405 aa  333  4e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.05 
 
 
459 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0516461  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.2 
 
 
452 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>