More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0042 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  100 
 
 
396 aa  804    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  46.17 
 
 
405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1216  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.97 
 
 
448 aa  323  3e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0401789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.64 
 
 
400 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.62 
 
 
398 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.93 
 
 
404 aa  315  9e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.23 
 
 
463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.94 
 
 
461 aa  307  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.86 
 
 
456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000149221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.86 
 
 
456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000102008  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.86 
 
 
456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  39.86 
 
 
456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000142965  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.08 
 
 
453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39 
 
 
457 aa  303  4.0000000000000003e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.39 
 
 
458 aa  302  6.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000130865  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.63 
 
 
456 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.63 
 
 
456 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.95 
 
 
475 aa  300  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.84 
 
 
403 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.32 
 
 
476 aa  299  5e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.79 
 
 
453 aa  299  7e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39 
 
 
449 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.27 
 
 
448 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.68 
 
 
446 aa  296  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.47 
 
 
449 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.32 
 
 
449 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.32 
 
 
449 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.32 
 
 
443 aa  296  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.18 
 
 
443 aa  295  6e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3734  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.63 
 
 
456 aa  296  6e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000326312  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.09 
 
 
407 aa  296  6e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000325061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.29 
 
 
462 aa  294  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.68 
 
 
454 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.17 
 
 
458 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.73 
 
 
455 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.42 
 
 
456 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.94 
 
 
451 aa  293  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.95 
 
 
459 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.71 
 
 
465 aa  293  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.78 
 
 
449 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.63 
 
 
463 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  38.89 
 
 
405 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.17 
 
 
444 aa  290  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3121  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.58 
 
 
444 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2360  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.63 
 
 
447 aa  290  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.203365  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  43.66 
 
 
450 aa  290  3e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.57 
 
 
451 aa  290  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.19 
 
 
458 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4728  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.39 
 
 
392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.59 
 
 
448 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1296  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.14 
 
 
442 aa  288  9e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430502  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.3 
 
 
463 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.02 
 
 
463 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.3 
 
 
459 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1777  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.17 
 
 
428 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.49 
 
 
463 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39 
 
 
411 aa  288  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.88 
 
 
452 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.88 
 
 
452 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.82 
 
 
446 aa  287  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000016399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.47 
 
 
464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0430  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.78 
 
 
414 aa  287  2.9999999999999996e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.11 
 
 
452 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.11 
 
 
452 aa  286  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1767  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.51 
 
 
447 aa  286  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00135793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.88 
 
 
452 aa  285  7e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1136  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.5 
 
 
450 aa  285  7e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000110023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.88 
 
 
452 aa  285  7e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.64 
 
 
452 aa  285  8e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.64 
 
 
452 aa  285  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.64 
 
 
452 aa  285  8e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1558  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.53 
 
 
442 aa  285  9e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0686099  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.81 
 
 
448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.8 
 
 
423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.67 
 
 
469 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15230  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.94 
 
 
459 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173867  hitchhiker  0.000000000874033 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.79 
 
 
448 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.87 
 
 
448 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1890  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.36 
 
 
446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2647  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.59 
 
 
466 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1304  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.64 
 
 
448 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566056  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2951  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.22 
 
 
447 aa  282  8.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19698  normal  0.152138 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1378  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.59 
 
 
448 aa  282  9e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1233  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.64 
 
 
448 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1670  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.71 
 
 
401 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014352  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.76 
 
 
402 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1339  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.94 
 
 
462 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.92 
 
 
406 aa  281  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.21 
 
 
458 aa  280  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.44 
 
 
402 aa  280  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.84 
 
 
448 aa  279  6e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.09 
 
 
400 aa  278  8e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2567  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.28 
 
 
436 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00271156 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.29 
 
 
414 aa  277  2e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.13 
 
 
407 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.09 
 
 
400 aa  276  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1301  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.55 
 
 
459 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000114365  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3125  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.45 
 
 
442 aa  276  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284972  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.03 
 
 
414 aa  276  5e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.17 
 
 
407 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>