More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1777 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1777  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  100 
 
 
428 aa  849    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.44 
 
 
463 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.78 
 
 
463 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.89 
 
 
459 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.3 
 
 
476 aa  299  7e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.55 
 
 
463 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.66 
 
 
463 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.44 
 
 
463 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.35 
 
 
459 aa  296  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2951  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.26 
 
 
447 aa  295  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19698  normal  0.152138 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.64 
 
 
443 aa  293  6e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.21 
 
 
451 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.08 
 
 
444 aa  290  4e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.81 
 
 
446 aa  290  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.17 
 
 
396 aa  288  1e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.06 
 
 
458 aa  286  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.32 
 
 
458 aa  286  5e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.67 
 
 
448 aa  286  7e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1339  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.24 
 
 
462 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1216  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.39 
 
 
448 aa  285  8e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0401789  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.61 
 
 
443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4244  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.63 
 
 
444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  39.53 
 
 
450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15230  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.01 
 
 
459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173867  hitchhiker  0.000000000874033 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.41 
 
 
467 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.92 
 
 
448 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.1 
 
 
456 aa  280  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.95 
 
 
453 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.8 
 
 
454 aa  278  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.58 
 
 
453 aa  276  7e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.62 
 
 
449 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.51 
 
 
445 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.72 
 
 
448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.39 
 
 
449 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.39 
 
 
449 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.39 
 
 
449 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1017  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.8 
 
 
398 aa  272  7e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1558  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.04 
 
 
442 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0686099  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1233  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.01 
 
 
448 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2360  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.55 
 
 
447 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.203365  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1304  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.78 
 
 
448 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566056  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0539  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.49 
 
 
459 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.76 
 
 
475 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0605  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.96 
 
 
516 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.32 
 
 
445 aa  270  5e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.16 
 
 
449 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.36 
 
 
448 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.04 
 
 
454 aa  269  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.82 
 
 
448 aa  269  8e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.55 
 
 
456 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.35 
 
 
451 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.55 
 
 
456 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.3 
 
 
448 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.4 
 
 
457 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.3 
 
 
448 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.09 
 
 
456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000149221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.09 
 
 
456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000102008  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.09 
 
 
456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.12 
 
 
452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  35.09 
 
 
456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000142965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.8 
 
 
411 aa  266  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.09 
 
 
455 aa  266  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.12 
 
 
452 aa  266  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3125  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.88 
 
 
442 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284972  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2759  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.55 
 
 
443 aa  266  7e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.340088  normal  0.610939 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2085  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.16 
 
 
465 aa  266  8e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2006  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.19 
 
 
444 aa  264  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.9 
 
 
407 aa  264  3e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0888  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.38 
 
 
443 aa  263  4e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1378  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.07 
 
 
448 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3121  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.4 
 
 
444 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.65 
 
 
452 aa  263  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.65 
 
 
452 aa  263  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2647  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.09 
 
 
466 aa  263  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.65 
 
 
452 aa  263  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.65 
 
 
452 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.65 
 
 
452 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.65 
 
 
452 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.65 
 
 
452 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0857  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.19 
 
 
443 aa  262  8.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.83 
 
 
465 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.98 
 
 
414 aa  261  1e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3734  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.09 
 
 
456 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000326312  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.75 
 
 
414 aa  261  2e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.53 
 
 
462 aa  260  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2514  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.23 
 
 
401 aa  260  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.7 
 
 
455 aa  260  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  36.79 
 
 
452 aa  260  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0752  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.92 
 
 
460 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.955357  normal  0.27096 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.97 
 
 
458 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.91 
 
 
460 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782017  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.42 
 
 
452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1296  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.18 
 
 
442 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430502  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.42 
 
 
445 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.6 
 
 
459 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0516461  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.07 
 
 
460 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144595  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.84 
 
 
404 aa  257  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1136  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.05 
 
 
450 aa  257  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000110023  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2462  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.07 
 
 
460 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422545 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1415  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.27 
 
 
494 aa  257  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0998332  normal  0.187038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>