More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1017 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1017  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  100 
 
 
398 aa  802    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.72 
 
 
445 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2759  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.38 
 
 
443 aa  292  9e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.340088  normal  0.610939 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.84 
 
 
448 aa  290  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.83 
 
 
453 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.37 
 
 
405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2085  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.07 
 
 
465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.9 
 
 
456 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.39 
 
 
463 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.09 
 
 
443 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.32 
 
 
443 aa  282  8.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.22 
 
 
457 aa  282  9e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.13 
 
 
456 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000149221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.13 
 
 
456 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000102008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  37.13 
 
 
456 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000142965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.13 
 
 
456 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.13 
 
 
456 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.33 
 
 
475 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1216  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.3 
 
 
448 aa  281  2e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0401789  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2006  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.82 
 
 
444 aa  280  2e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.05 
 
 
404 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.35 
 
 
448 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.76 
 
 
454 aa  279  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.79 
 
 
446 aa  279  7e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1979  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.55 
 
 
414 aa  278  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337025  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1415  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.22 
 
 
494 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0998332  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.28 
 
 
467 aa  277  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.55 
 
 
476 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.21 
 
 
400 aa  276  6e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.93 
 
 
458 aa  275  8e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.9 
 
 
396 aa  275  9e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.1 
 
 
446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.95 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.32 
 
 
414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.57 
 
 
414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.62 
 
 
451 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.14 
 
 
449 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.14 
 
 
449 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.16 
 
 
459 aa  272  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1777  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.8 
 
 
428 aa  272  7e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.85 
 
 
403 aa  272  7e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.16 
 
 
444 aa  272  7e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1670  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.07 
 
 
401 aa  272  8.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014352  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.99 
 
 
455 aa  272  9e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.91 
 
 
449 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.69 
 
 
469 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.76 
 
 
465 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1558  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.94 
 
 
442 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0686099  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.7 
 
 
449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2951  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.84 
 
 
447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19698  normal  0.152138 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.86 
 
 
463 aa  269  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.64 
 
 
461 aa  269  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1296  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.07 
 
 
442 aa  270  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430502  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.93 
 
 
449 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.84 
 
 
463 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.22 
 
 
398 aa  269  8e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.63 
 
 
463 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.35 
 
 
402 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3734  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.13 
 
 
456 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000326312  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.84 
 
 
448 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.51 
 
 
455 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.16 
 
 
458 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000130865  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.84 
 
 
459 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.19 
 
 
446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000016399  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.78 
 
 
462 aa  266  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4244  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.04 
 
 
444 aa  266  5e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.39 
 
 
445 aa  266  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.61 
 
 
463 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.53 
 
 
423 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2360  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.64 
 
 
447 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.203365  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.34 
 
 
456 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.26 
 
 
451 aa  263  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.58 
 
 
475 aa  263  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.26 
 
 
458 aa  263  4e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0315  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.12 
 
 
406 aa  263  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.83 
 
 
447 aa  263  6e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2996  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.83 
 
 
527 aa  262  8.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.97 
 
 
406 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0681  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.79 
 
 
416 aa  260  2e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.57 
 
 
408 aa  260  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.78 
 
 
448 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.78 
 
 
448 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1339  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.01 
 
 
462 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.32 
 
 
464 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.47 
 
 
445 aa  260  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1615  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.72 
 
 
445 aa  260  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000193789  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1582  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.72 
 
 
445 aa  260  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117148  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.16 
 
 
448 aa  260  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0764  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.62 
 
 
511 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130053  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3218  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.63 
 
 
457 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.57 
 
 
448 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1136  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.67 
 
 
450 aa  259  6e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000110023  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15230  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.01 
 
 
459 aa  259  6e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173867  hitchhiker  0.000000000874033 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0712  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.62 
 
 
511 aa  259  7e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1304  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.45 
 
 
448 aa  259  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566056  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1378  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.55 
 
 
448 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1233  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.7 
 
 
448 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.59 
 
 
407 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  34.62 
 
 
450 aa  258  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3148  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.45 
 
 
492 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>