More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0605 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0605  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
516 aa  1066    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2996  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.18 
 
 
527 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0764  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.54 
 
 
511 aa  282  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130053  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0539  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.85 
 
 
459 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0712  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.35 
 
 
511 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1378  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.53 
 
 
448 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.52 
 
 
451 aa  274  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.09 
 
 
475 aa  274  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.7 
 
 
464 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.53 
 
 
448 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.59 
 
 
448 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1233  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.07 
 
 
448 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1304  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.87 
 
 
448 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566056  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.33 
 
 
448 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0752  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.47 
 
 
460 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.955357  normal  0.27096 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.71 
 
 
462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1777  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.96 
 
 
428 aa  270  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.07 
 
 
448 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.53 
 
 
461 aa  269  7e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.7 
 
 
458 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.5 
 
 
449 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.17 
 
 
457 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.86 
 
 
458 aa  268  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.97 
 
 
453 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2647  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.53 
 
 
466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.33 
 
 
448 aa  267  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1670  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  48.06 
 
 
401 aa  266  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014352  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.34 
 
 
446 aa  266  5e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.07 
 
 
460 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144595  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2462  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.87 
 
 
460 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422545 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.06 
 
 
444 aa  266  8e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.79 
 
 
455 aa  266  8.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1767  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.27 
 
 
447 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00135793  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.5 
 
 
449 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.51 
 
 
475 aa  265  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.87 
 
 
469 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.5 
 
 
449 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.46 
 
 
459 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0516461  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.58 
 
 
445 aa  264  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.16 
 
 
458 aa  264  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.29 
 
 
456 aa  263  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1226  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.05 
 
 
528 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.901078  normal  0.0774047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.31 
 
 
449 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.99 
 
 
456 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.91 
 
 
449 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.99 
 
 
456 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.18 
 
 
455 aa  263  8e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.21 
 
 
453 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.99 
 
 
456 aa  262  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000149221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.99 
 
 
456 aa  262  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000102008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  42.99 
 
 
456 aa  262  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000142965  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.08 
 
 
460 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782017  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3734  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.29 
 
 
456 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000326312  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3195  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.06 
 
 
459 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300243  normal  0.30831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.99 
 
 
465 aa  260  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.51 
 
 
451 aa  261  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.19 
 
 
458 aa  260  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000130865  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.92 
 
 
454 aa  259  7e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2644  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.77 
 
 
436 aa  259  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.603733  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.26 
 
 
443 aa  259  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2759  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.59 
 
 
443 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.340088  normal  0.610939 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.34 
 
 
463 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2360  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.27 
 
 
447 aa  258  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.203365  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.85 
 
 
443 aa  257  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1136  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.12 
 
 
450 aa  257  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000110023  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1352  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.63 
 
 
537 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60305  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1238  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37 
 
 
549 aa  256  6e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122237  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0628  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.64 
 
 
485 aa  256  6e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.088972 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.86 
 
 
396 aa  256  7e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4549  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.61 
 
 
526 aa  256  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.31 
 
 
476 aa  256  8e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.81 
 
 
404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4284  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.34 
 
 
527 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671183  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1932  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.48 
 
 
460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2544  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.48 
 
 
460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146847  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2568  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.48 
 
 
460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0973694  normal  0.16842 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.07 
 
 
445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  47.83 
 
 
398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.4 
 
 
510 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00935981  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2946  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33 
 
 
436 aa  254  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.877345 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0929  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.4 
 
 
460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.344174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0932  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.4 
 
 
460 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29303  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0567  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.2 
 
 
510 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0175948  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1044  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.2 
 
 
460 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000021456  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2272  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.2 
 
 
460 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00826344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1890  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.98 
 
 
446 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101941  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2149  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.2 
 
 
460 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.71 
 
 
452 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.71 
 
 
452 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2006  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.22 
 
 
444 aa  252  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2085  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50 
 
 
465 aa  252  1e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.09 
 
 
448 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.6 
 
 
446 aa  252  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000016399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.71 
 
 
452 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3148  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.58 
 
 
492 aa  252  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.71 
 
 
452 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.91 
 
 
452 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0743  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.15 
 
 
561 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.71 
 
 
452 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.47 
 
 
458 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>