More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0628 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0628  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
485 aa  956    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.088972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0620  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  57.08 
 
 
477 aa  497  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419722  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  58.43 
 
 
519 aa  474  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1413  exodeoxyribonuclease VII large subunit  57.69 
 
 
496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6068  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.21 
 
 
507 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0339601  normal  0.285374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4330  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.85 
 
 
548 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554584  normal  0.651535 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0494  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.36 
 
 
519 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3300  exodeoxyribonuclease VII large subunit  61.01 
 
 
519 aa  461  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3174  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.46 
 
 
541 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.515348  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2996  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.95 
 
 
527 aa  460  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3873  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  56.25 
 
 
522 aa  455  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633021  normal  0.0839806 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1845  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.36 
 
 
519 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.264563  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1352  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.02 
 
 
537 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3498  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.47 
 
 
526 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4183  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  56.84 
 
 
523 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2553  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.19 
 
 
541 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.30129  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4621  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.82 
 
 
541 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0634  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.16 
 
 
519 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0667  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  53.64 
 
 
566 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0764  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.03 
 
 
511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130053  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6605  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55 
 
 
531 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0712  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.31 
 
 
511 aa  442  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4549  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.49 
 
 
526 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50 
 
 
536 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1945  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.6 
 
 
502 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4284  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.9 
 
 
527 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671183  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.16 
 
 
543 aa  438  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.958847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1695  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.6 
 
 
536 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1859  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.69 
 
 
538 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.020819 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0159  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.08 
 
 
537 aa  428  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.07 
 
 
475 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2727  exodeoxyribonuclease 7 large subunit  50.79 
 
 
523 aa  426  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0564335  normal  0.143765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0182  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.72 
 
 
519 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1238  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  49.09 
 
 
549 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122237  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1226  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.19 
 
 
528 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.901078  normal  0.0774047 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1034  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.95 
 
 
476 aa  412  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.31032  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3148  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.12 
 
 
492 aa  411  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0398  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  49.59 
 
 
521 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.636778 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0171  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.25 
 
 
453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1331  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  52.67 
 
 
462 aa  391  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.701446  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2864  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  49.03 
 
 
486 aa  347  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265405  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.79 
 
 
454 aa  307  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0029  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.44 
 
 
388 aa  302  1e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0282686  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0056  putative exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.79 
 
 
388 aa  295  9e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.72 
 
 
448 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.68 
 
 
475 aa  278  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.93 
 
 
453 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.24 
 
 
452 aa  276  8e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.49 
 
 
446 aa  276  8e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.57 
 
 
452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1890  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.68 
 
 
446 aa  274  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101941  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.95 
 
 
476 aa  274  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.57 
 
 
452 aa  274  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.34 
 
 
452 aa  273  6e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.34 
 
 
452 aa  273  6e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.34 
 
 
452 aa  272  9e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.34 
 
 
452 aa  272  9e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.34 
 
 
452 aa  272  9e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.34 
 
 
452 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.34 
 
 
452 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.8 
 
 
405 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.7 
 
 
445 aa  270  5e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0612657  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.76 
 
 
453 aa  269  8e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.32 
 
 
451 aa  269  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.21 
 
 
406 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.94 
 
 
404 aa  266  7e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.29 
 
 
455 aa  264  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.44 
 
 
444 aa  263  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1670  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.09 
 
 
401 aa  262  8e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014352  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.94 
 
 
448 aa  263  8e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.36 
 
 
463 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3218  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.74 
 
 
457 aa  261  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.81 
 
 
463 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.5 
 
 
451 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.81 
 
 
459 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.81 
 
 
463 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1216  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.58 
 
 
448 aa  260  4e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0401789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.24 
 
 
458 aa  260  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1339  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.41 
 
 
462 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.74 
 
 
411 aa  258  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.93 
 
 
469 aa  258  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.42 
 
 
458 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15230  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.18 
 
 
459 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173867  hitchhiker  0.000000000874033 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1767  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.61 
 
 
447 aa  257  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00135793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.52 
 
 
398 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0605  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.64 
 
 
516 aa  257  4e-67  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.02 
 
 
463 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.02 
 
 
463 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1221  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.3 
 
 
542 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1615  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.45 
 
 
445 aa  256  6e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000193789  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1582  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.45 
 
 
445 aa  256  6e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117148  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1719  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.43 
 
 
454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.623668  hitchhiker  0.0000296907 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1153  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.08 
 
 
542 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.38 
 
 
407 aa  254  3e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000325061  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.53 
 
 
396 aa  253  8.000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.23 
 
 
400 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.38 
 
 
403 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.28 
 
 
447 aa  251  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.78 
 
 
456 aa  250  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.65 
 
 
422 aa  250  4e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000320124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>