More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0321 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0321  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
407 aa  844    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.568977  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2413  exodeoxyribonuclease VII large subunit  62.03 
 
 
402 aa  510  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2078  exodeoxyribonuclease VII large subunit  63.71 
 
 
402 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2037  exodeoxyribonuclease VII large subunit  59.39 
 
 
465 aa  484  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0340  exodeoxyribonuclease VII large subunit  58.99 
 
 
402 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.194852 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2064  exodeoxyribonuclease VII large subunit  57.14 
 
 
403 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1865  exodeoxyribonuclease VII large subunit  56.1 
 
 
411 aa  427  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.862893 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.64 
 
 
406 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.22 
 
 
398 aa  299  6e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.48 
 
 
404 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4728  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.06 
 
 
392 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.46 
 
 
475 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.39 
 
 
423 aa  280  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.5 
 
 
453 aa  277  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1670  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.35 
 
 
401 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014352  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.65 
 
 
411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.25 
 
 
453 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1695  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.36 
 
 
536 aa  270  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1536  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.2 
 
 
401 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0037923  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.87 
 
 
458 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.25 
 
 
407 aa  266  4e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.96 
 
 
393 aa  266  5.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.41 
 
 
458 aa  266  7e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4621  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.18 
 
 
541 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.82 
 
 
400 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.82 
 
 
400 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.06 
 
 
469 aa  264  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1352  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.69 
 
 
537 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60305  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0620  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.76 
 
 
477 aa  262  8.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419722  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.99 
 
 
393 aa  262  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1859  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.42 
 
 
538 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.020819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1890  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.5 
 
 
446 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101941  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.75 
 
 
407 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.28 
 
 
414 aa  261  2e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.69 
 
 
454 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3174  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.36 
 
 
541 aa  261  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.515348  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.02 
 
 
414 aa  261  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1413  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.12 
 
 
496 aa  260  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.4 
 
 
536 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4284  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.91 
 
 
527 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671183  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3498  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.06 
 
 
526 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0857  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.35 
 
 
443 aa  259  8e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.47 
 
 
448 aa  259  8e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1603  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.75 
 
 
410 aa  258  1e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2553  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.2 
 
 
541 aa  258  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.30129  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4549  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.91 
 
 
526 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.19 
 
 
398 aa  258  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.88 
 
 
455 aa  258  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.92 
 
 
400 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.76 
 
 
452 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.99 
 
 
452 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.99 
 
 
452 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.99 
 
 
452 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.99 
 
 
452 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.99 
 
 
452 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.19 
 
 
458 aa  258  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1753  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.88 
 
 
407 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.198539 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.22 
 
 
452 aa  257  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6068  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.06 
 
 
507 aa  257  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0339601  normal  0.285374 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.22 
 
 
452 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0888  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.75 
 
 
443 aa  256  4e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.63 
 
 
458 aa  256  4e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.53 
 
 
405 aa  256  4e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.59 
 
 
448 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.49 
 
 
543 aa  255  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.958847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.76 
 
 
452 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6605  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.31 
 
 
531 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0079449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.76 
 
 
452 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0398  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.38 
 
 
521 aa  253  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.636778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3148  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.51 
 
 
492 aa  253  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0681  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.31 
 
 
416 aa  253  3e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.85 
 
 
406 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.38 
 
 
422 aa  253  3e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000320124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.22 
 
 
451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.57 
 
 
446 aa  253  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_002620  TC0605  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.64 
 
 
516 aa  252  7e-66  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0056  putative exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.12 
 
 
388 aa  252  1e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0628  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.76 
 
 
485 aa  251  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.088972 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0430  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.65 
 
 
414 aa  251  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0712  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.44 
 
 
511 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2996  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.25 
 
 
527 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1719  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.69 
 
 
454 aa  250  3e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.623668  hitchhiker  0.0000296907 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.87 
 
 
402 aa  250  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0764  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.44 
 
 
511 aa  250  4e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130053  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1615  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.73 
 
 
445 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000193789  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1582  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.73 
 
 
445 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117148  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1034  Exodeoxyribonuclease VII  38.36 
 
 
447 aa  249  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.45 
 
 
403 aa  249  7e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  37.79 
 
 
405 aa  249  7e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1767  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.01 
 
 
447 aa  249  9e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00135793  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.93 
 
 
475 aa  249  9e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.2 
 
 
445 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0029  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.13 
 
 
388 aa  248  1e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0282686  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.15 
 
 
408 aa  247  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1945  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.92 
 
 
502 aa  247  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1238  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.99 
 
 
549 aa  246  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122237  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  35.73 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0667  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.41 
 
 
566 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0171  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.94 
 
 
453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>