More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6605 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6605  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  100 
 
 
531 aa  1010    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0079449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6068  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  91.65 
 
 
507 aa  838    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0339601  normal  0.285374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4330  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  67.71 
 
 
548 aa  616  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554584  normal  0.651535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0667  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  65.43 
 
 
566 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4183  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  68.02 
 
 
523 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3873  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  67.82 
 
 
522 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633021  normal  0.0839806 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1352  exodeoxyribonuclease VII large subunit  56.88 
 
 
537 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3498  exodeoxyribonuclease VII large subunit  57.2 
 
 
526 aa  528  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0398  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  58.77 
 
 
521 aa  526  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.636778 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1413  exodeoxyribonuclease VII large subunit  64.04 
 
 
496 aa  527  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2553  exodeoxyribonuclease VII large subunit  55.72 
 
 
541 aa  524  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.30129  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3174  exodeoxyribonuclease VII large subunit  55.16 
 
 
541 aa  522  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.515348  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4621  exodeoxyribonuclease VII large subunit  57.52 
 
 
541 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1695  exodeoxyribonuclease VII large subunit  57.6 
 
 
536 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1238  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  58.3 
 
 
549 aa  514  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122237  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4549  exodeoxyribonuclease VII large subunit  55.75 
 
 
526 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4284  exodeoxyribonuclease VII large subunit  55.09 
 
 
527 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671183  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0620  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  56.37 
 
 
477 aa  511  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419722  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  54.22 
 
 
536 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1859  exodeoxyribonuclease VII large subunit  56.69 
 
 
538 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.020819 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2996  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.85 
 
 
527 aa  500  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.56 
 
 
543 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.958847  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0712  exodeoxyribonuclease VII large subunit  55.1 
 
 
511 aa  480  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0764  exodeoxyribonuclease VII large subunit  55.1 
 
 
511 aa  480  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130053  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0182  exodeoxyribonuclease VII large subunit  55.71 
 
 
519 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1845  exodeoxyribonuclease VII large subunit  55.32 
 
 
519 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.264563  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0634  exodeoxyribonuclease VII large subunit  56.62 
 
 
519 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0494  exodeoxyribonuclease VII large subunit  55.13 
 
 
519 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1034  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.37 
 
 
476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.31032  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0628  exodeoxyribonuclease VII large subunit  54.72 
 
 
485 aa  444  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.088972 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.56 
 
 
519 aa  443  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0159  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.71 
 
 
537 aa  433  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3300  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.58 
 
 
519 aa  432  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1945  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50 
 
 
502 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.99 
 
 
475 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2727  exodeoxyribonuclease 7 large subunit  51.65 
 
 
523 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0564335  normal  0.143765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3148  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.27 
 
 
492 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1226  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.19 
 
 
528 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.901078  normal  0.0774047 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0171  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.21 
 
 
453 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1331  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.53 
 
 
462 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.701446  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2864  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  49.37 
 
 
486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265405  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.83 
 
 
475 aa  289  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0029  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.55 
 
 
388 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0282686  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0056  putative exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.2 
 
 
388 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.88 
 
 
458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.88 
 
 
458 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.74 
 
 
455 aa  276  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.7 
 
 
463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.96 
 
 
453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.99 
 
 
469 aa  273  6e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1890  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.61 
 
 
446 aa  270  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101941  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.7 
 
 
459 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.48 
 
 
463 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.26 
 
 
463 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.88 
 
 
453 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1767  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.17 
 
 
447 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00135793  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.34 
 
 
463 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.45 
 
 
448 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.04 
 
 
476 aa  263  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.27 
 
 
463 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.75 
 
 
457 aa  262  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.93 
 
 
461 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.94 
 
 
454 aa  261  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.74 
 
 
451 aa  259  6e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.39 
 
 
451 aa  259  7e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.75 
 
 
452 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.75 
 
 
452 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.75 
 
 
452 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.97 
 
 
452 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.97 
 
 
452 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.18 
 
 
452 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.56 
 
 
459 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.53 
 
 
446 aa  258  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2037  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.37 
 
 
465 aa  258  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.18 
 
 
452 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.75 
 
 
452 aa  258  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.69 
 
 
449 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.75 
 
 
452 aa  258  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.15 
 
 
456 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2413  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.25 
 
 
402 aa  257  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.69 
 
 
449 aa  257  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.48 
 
 
449 aa  256  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1052  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.11 
 
 
448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.12 
 
 
444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.48 
 
 
449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.75 
 
 
422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000320124  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.69 
 
 
449 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.12 
 
 
452 aa  254  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.28 
 
 
448 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.9 
 
 
411 aa  253  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  46.75 
 
 
406 aa  252  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.79 
 
 
443 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2064  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.4 
 
 
403 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.66 
 
 
458 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1184  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.37 
 
 
446 aa  251  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.389235  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.44 
 
 
458 aa  251  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.23 
 
 
455 aa  250  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.58 
 
 
443 aa  250  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2078  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.66 
 
 
402 aa  249  9e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1865  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.15 
 
 
411 aa  248  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.862893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>