More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1719 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1719  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  100 
 
 
454 aa  937    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.623668  hitchhiker  0.0000296907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.74 
 
 
476 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.57 
 
 
454 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.14 
 
 
463 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.95 
 
 
451 aa  307  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.44 
 
 
475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.95 
 
 
458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.6 
 
 
463 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.23 
 
 
448 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.68 
 
 
463 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.3 
 
 
453 aa  299  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.43 
 
 
456 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.05 
 
 
458 aa  295  9e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.25 
 
 
453 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.09 
 
 
458 aa  292  9e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1890  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.53 
 
 
446 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101941  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.27 
 
 
444 aa  291  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.63 
 
 
458 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.06 
 
 
459 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.86 
 
 
404 aa  290  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.91 
 
 
459 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.8 
 
 
452 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.8 
 
 
452 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.8 
 
 
452 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.8 
 
 
452 aa  288  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.68 
 
 
463 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.81 
 
 
452 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.81 
 
 
452 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.41 
 
 
446 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.8 
 
 
452 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2514  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.66 
 
 
401 aa  286  5e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.45 
 
 
463 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.56 
 
 
452 aa  286  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.56 
 
 
452 aa  286  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.38 
 
 
452 aa  285  8e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  38.88 
 
 
452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.05 
 
 
457 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.03 
 
 
455 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.57 
 
 
454 aa  284  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.11 
 
 
449 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.32 
 
 
451 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.7 
 
 
449 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1767  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.03 
 
 
447 aa  282  9e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00135793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.97 
 
 
411 aa  282  9e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1339  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.74 
 
 
462 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.7 
 
 
449 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3211  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.24 
 
 
450 aa  280  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173866  normal  0.203327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.47 
 
 
449 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15230  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.74 
 
 
459 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173867  hitchhiker  0.000000000874033 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1216  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.91 
 
 
448 aa  279  8e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0401789  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.24 
 
 
449 aa  279  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.44 
 
 
456 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000149221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.44 
 
 
456 aa  278  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000102008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  37.44 
 
 
456 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40 
 
 
455 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.18 
 
 
461 aa  277  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.44 
 
 
456 aa  276  4e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.44 
 
 
456 aa  276  4e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.68 
 
 
398 aa  276  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.22 
 
 
456 aa  276  5e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1034  Exodeoxyribonuclease VII  42.86 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.38 
 
 
405 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.41 
 
 
447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.66 
 
 
448 aa  273  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.93 
 
 
414 aa  271  1e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.67 
 
 
467 aa  271  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.5 
 
 
462 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.64 
 
 
446 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2398  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.46 
 
 
467 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.64 
 
 
448 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1378  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.43 
 
 
448 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.93 
 
 
414 aa  270  5e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.73 
 
 
464 aa  269  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1304  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.43 
 
 
448 aa  269  7e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566056  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3734  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.44 
 
 
456 aa  269  8e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000326312  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.95 
 
 
443 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.33 
 
 
443 aa  268  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.05 
 
 
423 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.58 
 
 
458 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000130865  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.17 
 
 
400 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.52 
 
 
459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0516461  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.13 
 
 
465 aa  266  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.86 
 
 
407 aa  266  4e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000325061  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1233  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.19 
 
 
448 aa  267  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.43 
 
 
448 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0752  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.71 
 
 
460 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.955357  normal  0.27096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.85 
 
 
460 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782017  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.73 
 
 
403 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.57 
 
 
408 aa  264  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.69 
 
 
400 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.19 
 
 
448 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2647  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.96 
 
 
466 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2804  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.82 
 
 
469 aa  262  8e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345975  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2527  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.5 
 
 
440 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.258922  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.58 
 
 
445 aa  262  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.19 
 
 
448 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0315  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.07 
 
 
406 aa  262  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2462  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.74 
 
 
460 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422545 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0888  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.31 
 
 
443 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.16 
 
 
445 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>