More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1128 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1128  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
460 aa  946    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7199  Exodeoxyribonuclease VII  31.28 
 
 
475 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3317  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.88 
 
 
387 aa  200  5e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3775  exodeoxyribonuclease VII  28.93 
 
 
478 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1209  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.72 
 
 
522 aa  194  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000650219  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2199  Exodeoxyribonuclease VII  28.36 
 
 
464 aa  193  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.503662  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0501  Exodeoxyribonuclease VII  36.86 
 
 
404 aa  190  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0178  exodeoxyribonuclease VII  29.66 
 
 
526 aa  187  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106589  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0236  Exodeoxyribonuclease VII  37.09 
 
 
526 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1869  exodeoxyribonuclease VII  28.27 
 
 
530 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.205151  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1291  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.09 
 
 
516 aa  178  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00804407  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1369  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.48 
 
 
508 aa  177  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0465393 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1091  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37 
 
 
514 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0198  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.57 
 
 
555 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0148  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.66 
 
 
413 aa  164  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214735  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4878  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.4 
 
 
576 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.983312 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.9 
 
 
451 aa  141  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.51 
 
 
476 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.1 
 
 
463 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.13 
 
 
456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0262  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.26 
 
 
427 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.2 
 
 
463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3121  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.62 
 
 
444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698852  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  27.77 
 
 
452 aa  134  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.98 
 
 
463 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1926  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.11 
 
 
439 aa  133  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.54 
 
 
455 aa  132  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.33 
 
 
467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0952  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.83 
 
 
496 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2644  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.47 
 
 
436 aa  132  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.603733  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1557  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.6 
 
 
445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1761  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.33 
 
 
455 aa  131  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2302  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.81 
 
 
445 aa  131  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.21 
 
 
461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.14 
 
 
459 aa  130  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3148  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.11 
 
 
492 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1916  exodeoxyribonuclease VII  29.83 
 
 
478 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0537886  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  25.75 
 
 
450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.06 
 
 
469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3211  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.99 
 
 
450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173866  normal  0.203327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.88 
 
 
463 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2398  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.2 
 
 
467 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0939  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.03 
 
 
456 aa  128  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0421457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.63 
 
 
445 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4244  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.16 
 
 
444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2946  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.04 
 
 
436 aa  127  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.877345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.84 
 
 
455 aa  127  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0430  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.05 
 
 
414 aa  126  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.7 
 
 
447 aa  126  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1339  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.61 
 
 
462 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.85 
 
 
459 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1304  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.93 
 
 
448 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566056  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.27 
 
 
445 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0539  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.1 
 
 
459 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.47 
 
 
458 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.93 
 
 
448 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.36 
 
 
458 aa  124  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1233  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.15 
 
 
448 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.05 
 
 
456 aa  124  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.05 
 
 
456 aa  124  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1034  Exodeoxyribonuclease VII  29.25 
 
 
447 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2804  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.19 
 
 
469 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345975  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1136  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.58 
 
 
450 aa  124  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000110023  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.42 
 
 
463 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.09 
 
 
465 aa  123  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1569  exodeoxyribonuclease VII  29.11 
 
 
495 aa  123  8e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.1924  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.05 
 
 
456 aa  122  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000149221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.05 
 
 
456 aa  122  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000102008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  24.05 
 
 
456 aa  122  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000142965  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0857  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.98 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.13 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0888  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.2 
 
 
443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1296  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.79 
 
 
442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430502  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1413  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.6 
 
 
496 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1415  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.25 
 
 
494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0998332  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.13 
 
 
414 aa  121  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.13 
 
 
414 aa  121  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.98 
 
 
448 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.37 
 
 
459 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0516461  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3117  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.15 
 
 
424 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000975107  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3218  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.82 
 
 
457 aa  121  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15230  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.39 
 
 
459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173867  hitchhiker  0.000000000874033 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0620  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.27 
 
 
477 aa  120  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419722  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.92 
 
 
397 aa  120  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1093  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.69 
 
 
474 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18484  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.91 
 
 
457 aa  119  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.63 
 
 
456 aa  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3573  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.59 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.168579  hitchhiker  0.00774159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.21 
 
 
464 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2647  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.86 
 
 
466 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3734  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.47 
 
 
456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000326312  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0641  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.96 
 
 
449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.782635  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3174  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.58 
 
 
541 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.515348  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.47 
 
 
462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1890  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.06 
 
 
446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101941  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.32 
 
 
511 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.34 
 
 
449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3195  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.13 
 
 
459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300243  normal  0.30831 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.61 
 
 
445 aa  117  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.09 
 
 
446 aa  117  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000016399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>