More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3317 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3317  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  100 
 
 
387 aa  793    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0501  Exodeoxyribonuclease VII  39.36 
 
 
404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3775  exodeoxyribonuclease VII  38.95 
 
 
478 aa  252  6e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2199  Exodeoxyribonuclease VII  35.59 
 
 
464 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.503662  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7199  Exodeoxyribonuclease VII  35.17 
 
 
475 aa  235  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1128  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.88 
 
 
460 aa  200  3.9999999999999996e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1209  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.5 
 
 
522 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000650219  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0178  exodeoxyribonuclease VII  30.63 
 
 
526 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106589  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1091  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.81 
 
 
514 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0236  Exodeoxyribonuclease VII  29.04 
 
 
526 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4878  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.14 
 
 
576 aa  116  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.983312 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1291  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.58 
 
 
516 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00804407  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1369  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.92 
 
 
508 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0465393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1869  exodeoxyribonuclease VII  26.2 
 
 
530 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.205151  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0148  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.3 
 
 
413 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214735  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0198  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.17 
 
 
555 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.32 
 
 
511 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286827 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1722  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.51 
 
 
459 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.209021  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1309  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.7 
 
 
398 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.67 
 
 
445 aa  99  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1761  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.17 
 
 
455 aa  95.1  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2759  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.11 
 
 
443 aa  93.6  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.340088  normal  0.610939 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0368  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.33 
 
 
450 aa  90.5  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313066 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.4 
 
 
414 aa  90.1  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1188  Exodeoxyribonuclease VII  23.99 
 
 
529 aa  89  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0154172  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.13 
 
 
414 aa  89  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.23 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4728  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.11 
 
 
392 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.6 
 
 
393 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  22.91 
 
 
397 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01051  exodeoxyribonuclease VII  25.31 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125237  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1008  exonuclease VII large subunit  30.67 
 
 
467 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596723  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12180  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.1 
 
 
519 aa  84  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0262  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.37 
 
 
427 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.13 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2085  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.05 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1415  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.26 
 
 
494 aa  82.8  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0998332  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.34 
 
 
447 aa  82  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2006  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.05 
 
 
444 aa  82.4  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  21.52 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.92 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0952  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.3 
 
 
496 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1979  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  22.86 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337025  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1777  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.2 
 
 
428 aa  80.9  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  21.53 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.4 
 
 
476 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1670  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.01 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014352  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1132  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.73 
 
 
483 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692394  normal  0.0141184 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3117  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.57 
 
 
424 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000975107  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0939  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.44 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0421457  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.5 
 
 
463 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1569  exodeoxyribonuclease VII  35.67 
 
 
495 aa  78.2  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.1924  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  26.73 
 
 
452 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1093  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.52 
 
 
474 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18484  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6807  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.62 
 
 
501 aa  77  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0976698  normal  0.286525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.48 
 
 
459 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0430  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.46 
 
 
414 aa  77  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20410  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.19 
 
 
413 aa  77  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.586183  normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2647  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.5 
 
 
466 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1153  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.62 
 
 
542 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1221  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.62 
 
 
542 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31500  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.05 
 
 
419 aa  76.6  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208804  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.69 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.84 
 
 
463 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1460  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.89 
 
 
386 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1558  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.54 
 
 
442 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0686099  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2204  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.68 
 
 
486 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.76 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.17 
 
 
463 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0919  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.88 
 
 
442 aa  75.1  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.17 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1056  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.47 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.84 
 
 
463 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.79 
 
 
448 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.36 
 
 
453 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1056  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.47 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.79 
 
 
448 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.79 
 
 
448 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3498  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.01 
 
 
526 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02381  exonuclease VII, large subunit  32.89 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.22 
 
 
448 aa  73.9  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1184  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.29 
 
 
446 aa  73.9  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.389235  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  22.87 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.41 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0752  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.04 
 
 
456 aa  73.6  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0683823  hitchhiker  0.000291516 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.17 
 
 
463 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1916  exodeoxyribonuclease VII  37.12 
 
 
478 aa  73.2  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0537886  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1893  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.82 
 
 
424 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.185054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.5 
 
 
451 aa  73.2  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0888  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.87 
 
 
443 aa  73.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0878  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  22.78 
 
 
417 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2550  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  22.91 
 
 
448 aa  73.2  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306428 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  23.93 
 
 
450 aa  72.4  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0746  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  22.22 
 
 
467 aa  72.8  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.79 
 
 
458 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.09 
 
 
407 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3125  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.41 
 
 
442 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284972  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.62 
 
 
458 aa  72.4  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1753  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.54 
 
 
407 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.198539 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0641  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.82 
 
 
449 aa  71.6  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.782635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>