More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1916 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1916  exodeoxyribonuclease VII  100 
 
 
478 aa  971    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0537886  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1569  exodeoxyribonuclease VII  42.45 
 
 
495 aa  316  5e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.1924  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1008  exonuclease VII large subunit  39.44 
 
 
467 aa  278  1e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596723  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1128  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.81 
 
 
460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.11 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0612657  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.62 
 
 
455 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.5 
 
 
449 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1293  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.24 
 
 
387 aa  107  6e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1869  exodeoxyribonuclease VII  29.66 
 
 
530 aa  107  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.205151  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.5 
 
 
449 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.17 
 
 
449 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3734  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.41 
 
 
456 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000326312  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.96 
 
 
456 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000149221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.96 
 
 
456 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000102008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  23.96 
 
 
456 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000142965  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.6 
 
 
449 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0236  Exodeoxyribonuclease VII  34.34 
 
 
526 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.7 
 
 
456 aa  104  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.7 
 
 
456 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.44 
 
 
456 aa  105  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.43 
 
 
449 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.9 
 
 
453 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.27 
 
 
446 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.86 
 
 
457 aa  104  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7199  Exodeoxyribonuclease VII  26.67 
 
 
475 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1675  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.59 
 
 
387 aa  102  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0178  exodeoxyribonuclease VII  34.74 
 
 
526 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106589  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.91 
 
 
461 aa  100  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0057  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.68 
 
 
468 aa  100  7e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.91 
 
 
464 aa  100  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.17 
 
 
393 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.29 
 
 
393 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.44 
 
 
462 aa  99  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.33 
 
 
445 aa  98.2  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.48 
 
 
451 aa  98.2  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.23 
 
 
458 aa  97.8  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000130865  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  20.59 
 
 
465 aa  97.1  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0410  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.44 
 
 
459 aa  96.7  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000134785  hitchhiker  0.000369784 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1301  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.44 
 
 
459 aa  96.7  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000114365  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1193  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.44 
 
 
458 aa  96.7  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.10806e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.31 
 
 
443 aa  96.3  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0347  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.46 
 
 
387 aa  95.5  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0429  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.78 
 
 
491 aa  95.5  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000348661 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0370  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.46 
 
 
387 aa  95.5  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.284967  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1378  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.06 
 
 
448 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  25.91 
 
 
450 aa  95.1  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1604  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.61 
 
 
425 aa  94.4  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1634  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.94 
 
 
387 aa  94  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.718824  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2199  Exodeoxyribonuclease VII  38.46 
 
 
464 aa  94  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.503662  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.06 
 
 
448 aa  94  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0857  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.32 
 
 
443 aa  93.2  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.81 
 
 
448 aa  93.2  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0641  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.75 
 
 
449 aa  92.8  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.782635  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.25 
 
 
397 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.26 
 
 
405 aa  93.2  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31500  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.71 
 
 
419 aa  92.8  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208804  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24 
 
 
444 aa  92.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1296  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.96 
 
 
442 aa  92.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430502  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.86 
 
 
402 aa  92.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0888  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.79 
 
 
443 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.28 
 
 
443 aa  91.7  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2951  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.32 
 
 
447 aa  91.3  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19698  normal  0.152138 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1732  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.15 
 
 
480 aa  91.3  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.709367  hitchhiker  0.00631476 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0539  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.92 
 
 
459 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1006  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.81 
 
 
406 aa  91.3  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795132  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.61 
 
 
448 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.01 
 
 
387 aa  90.9  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.182071  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25 
 
 
448 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.82 
 
 
384 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.92 
 
 
454 aa  90.1  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3121  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.98 
 
 
444 aa  90.1  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698852  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.52 
 
 
445 aa  89.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3775  exodeoxyribonuclease VII  37.88 
 
 
478 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.56 
 
 
446 aa  89.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.8 
 
 
400 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  21.2 
 
 
448 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.47 
 
 
445 aa  89  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0952  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.19 
 
 
496 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1558  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.1 
 
 
442 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0686099  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.6 
 
 
407 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0315  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.12 
 
 
406 aa  88.6  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1932  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.37 
 
 
460 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2568  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.37 
 
 
460 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0973694  normal  0.16842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1136  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.25 
 
 
450 aa  88.6  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000110023  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2544  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.37 
 
 
460 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146847  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.33 
 
 
400 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.16 
 
 
407 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.55 
 
 
455 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.14 
 
 
408 aa  87.8  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1233  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.02 
 
 
448 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.97 
 
 
402 aa  87.8  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5539  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.53 
 
 
414 aa  87.8  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1761  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.5 
 
 
455 aa  87.4  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.19 
 
 
452 aa  87.4  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.26 
 
 
446 aa  87.4  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000016399  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1304  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.35 
 
 
448 aa  87.4  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566056  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.04 
 
 
458 aa  87.4  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2462  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.79 
 
 
460 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422545 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.37 
 
 
460 aa  87  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782017  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.79 
 
 
460 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>