More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2199 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2199  Exodeoxyribonuclease VII  100 
 
 
464 aa  954    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.503662  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7199  Exodeoxyribonuclease VII  46.88 
 
 
475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3775  exodeoxyribonuclease VII  46.15 
 
 
478 aa  431  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0501  Exodeoxyribonuclease VII  32.66 
 
 
404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3317  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.59 
 
 
387 aa  251  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1128  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.36 
 
 
460 aa  193  5e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0236  Exodeoxyribonuclease VII  33.22 
 
 
526 aa  143  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1091  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.42 
 
 
514 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1869  exodeoxyribonuclease VII  31.65 
 
 
530 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.205151  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1291  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.3 
 
 
516 aa  137  5e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00804407  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0178  exodeoxyribonuclease VII  32.12 
 
 
526 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106589  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1369  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.67 
 
 
508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0465393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0198  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.87 
 
 
555 aa  127  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0148  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.43 
 
 
413 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214735  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0262  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.51 
 
 
427 aa  116  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0368  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.18 
 
 
450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313066 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1209  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.76 
 
 
522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000650219  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4878  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.97 
 
 
576 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.983312 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.75 
 
 
446 aa  110  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000016399  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1136  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.12 
 
 
450 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000110023  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3117  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.72 
 
 
424 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000975107  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1008  exonuclease VII large subunit  35.5 
 
 
467 aa  107  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596723  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1296  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.91 
 
 
442 aa  106  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430502  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.04 
 
 
458 aa  106  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1558  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.43 
 
 
442 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0686099  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3125  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.92 
 
 
442 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284972  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.44 
 
 
427 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.618779  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.13 
 
 
459 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0516461  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.53 
 
 
511 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286827 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1216  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.95 
 
 
448 aa  102  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0401789  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  23.36 
 
 
405 aa  103  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0939  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.37 
 
 
412 aa  101  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3195  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.13 
 
 
459 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300243  normal  0.30831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.48 
 
 
445 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0743  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.72 
 
 
561 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26 
 
 
396 aa  100  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0529  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.92 
 
 
419 aa  100  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.31 
 
 
451 aa  99.8  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.01 
 
 
403 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3211  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.42 
 
 
450 aa  99.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173866  normal  0.203327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3009  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.44 
 
 
472 aa  99.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1309  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.95 
 
 
398 aa  99.8  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  24.84 
 
 
452 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25 
 
 
448 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0641  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.15 
 
 
449 aa  98.2  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.782635  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8274  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.27 
 
 
422 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2550  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.56 
 
 
448 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306428 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1511  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.23 
 
 
451 aa  98.2  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.823365  normal  0.344595 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.76 
 
 
448 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.06 
 
 
398 aa  98.2  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0539  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.71 
 
 
459 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2835  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.86 
 
 
428 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0519996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1378  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.54 
 
 
448 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.54 
 
 
448 aa  96.7  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.01 
 
 
397 aa  96.7  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2946  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.09 
 
 
436 aa  96.3  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.877345 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.32 
 
 
458 aa  96.3  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1719  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.27 
 
 
454 aa  95.9  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.623668  hitchhiker  0.0000296907 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.11 
 
 
448 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.41 
 
 
443 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.57 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.45 
 
 
384 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1221  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.87 
 
 
542 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.83 
 
 
463 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1153  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.87 
 
 
542 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2644  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.56 
 
 
436 aa  94.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.603733  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0878  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.8 
 
 
417 aa  94.4  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.02 
 
 
398 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.77 
 
 
455 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.16 
 
 
445 aa  94  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.86 
 
 
454 aa  94  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1304  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.11 
 
 
448 aa  94  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566056  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1101  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.05 
 
 
432 aa  94  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1916  exodeoxyribonuclease VII  38.46 
 
 
478 aa  93.6  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0537886  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  25.77 
 
 
450 aa  93.6  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1093  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.87 
 
 
474 aa  93.6  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18484  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0929  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.66 
 
 
460 aa  93.2  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.344174  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2647  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.68 
 
 
466 aa  93.2  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1132  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.18 
 
 
483 aa  93.2  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692394  normal  0.0141184 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.24 
 
 
414 aa  92.8  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2149  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.66 
 
 
460 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2272  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.66 
 
 
460 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00826344  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.66 
 
 
510 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00935981  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.46 
 
 
443 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.33 
 
 
414 aa  92.8  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20410  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.65 
 
 
413 aa  92.8  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.586183  normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1044  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.66 
 
 
460 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000021456  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.06 
 
 
406 aa  93.2  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.16 
 
 
448 aa  92.8  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0932  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.66 
 
 
460 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.48 
 
 
445 aa  92.8  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5539  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.52 
 
 
414 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3218  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.9 
 
 
457 aa  92.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0567  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.66 
 
 
510 aa  92.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0175948  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.9 
 
 
457 aa  92  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26430  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.23 
 
 
427 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0524422  normal  0.366699 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.36 
 
 
422 aa  92  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000320124  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01051  exodeoxyribonuclease VII  23.48 
 
 
382 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125237  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.62 
 
 
458 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000130865  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6807  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.15 
 
 
501 aa  91.3  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0976698  normal  0.286525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>