More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1309 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1309  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  100 
 
 
398 aa  800    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.16 
 
 
403 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.91 
 
 
407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000325061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.31 
 
 
398 aa  275  7e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.23 
 
 
448 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.4 
 
 
414 aa  270  5e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.66 
 
 
414 aa  269  7e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.57 
 
 
404 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1979  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.48 
 
 
414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337025  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.96 
 
 
453 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.71 
 
 
402 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.04 
 
 
411 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.78 
 
 
393 aa  263  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0529  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.44 
 
 
419 aa  261  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.45 
 
 
452 aa  260  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.45 
 
 
452 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6807  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.13 
 
 
501 aa  258  9e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0976698  normal  0.286525 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.48 
 
 
400 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.45 
 
 
452 aa  257  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.45 
 
 
452 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.45 
 
 
452 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.99 
 
 
405 aa  257  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.95 
 
 
469 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.45 
 
 
452 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.45 
 
 
452 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.37 
 
 
452 aa  256  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.37 
 
 
452 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.36 
 
 
445 aa  256  4e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0612657  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.79 
 
 
407 aa  256  6e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.35 
 
 
400 aa  255  7e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.84 
 
 
454 aa  255  8e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.32 
 
 
402 aa  255  9e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.22 
 
 
400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.09 
 
 
406 aa  253  6e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2514  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.6 
 
 
401 aa  252  7e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.45 
 
 
452 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35 
 
 
451 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.15 
 
 
467 aa  251  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.23 
 
 
423 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.2 
 
 
407 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.22 
 
 
406 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.29 
 
 
393 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.53 
 
 
397 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  38.07 
 
 
405 aa  246  4e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1603  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.97 
 
 
410 aa  245  8e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1153  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.34 
 
 
542 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1221  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.34 
 
 
542 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1093  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.97 
 
 
474 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18484  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1136  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.69 
 
 
450 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000110023  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.96 
 
 
446 aa  242  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.92 
 
 
448 aa  242  9e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2462  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.13 
 
 
460 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.26 
 
 
398 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.59 
 
 
476 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.76 
 
 
463 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.3 
 
 
443 aa  239  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2568  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.44 
 
 
460 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0973694  normal  0.16842 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1932  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.44 
 
 
460 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2544  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.44 
 
 
460 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146847  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.13 
 
 
460 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782017  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1753  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.75 
 
 
407 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.198539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.99 
 
 
448 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0752  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.93 
 
 
460 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.955357  normal  0.27096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.89 
 
 
460 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.99 
 
 
448 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1777  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.5 
 
 
428 aa  236  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1670  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.81 
 
 
401 aa  236  6e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014352  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0888  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.16 
 
 
443 aa  235  8e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.28 
 
 
447 aa  236  8e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1893  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.44 
 
 
424 aa  236  8e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.185054 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1304  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.4 
 
 
448 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566056  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.4 
 
 
458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.07 
 
 
446 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0857  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.93 
 
 
443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3009  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.87 
 
 
472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1233  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.62 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1415  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.27 
 
 
494 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0998332  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.62 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.8 
 
 
455 aa  233  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1536  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.91 
 
 
401 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0037923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2647  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.54 
 
 
466 aa  234  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.15 
 
 
446 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000016399  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1017  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.61 
 
 
398 aa  233  6e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.07 
 
 
443 aa  233  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.85 
 
 
463 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1378  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.54 
 
 
448 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3211  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.93 
 
 
450 aa  232  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173866  normal  0.203327 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  36.05 
 
 
452 aa  232  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.62 
 
 
459 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.55 
 
 
445 aa  230  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.84 
 
 
458 aa  230  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0743  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.73 
 
 
561 aa  230  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4728  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.44 
 
 
392 aa  230  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.93 
 
 
444 aa  229  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.4 
 
 
463 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  35.01 
 
 
450 aa  229  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1582  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.57 
 
 
445 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117148  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1615  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.57 
 
 
445 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000193789  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3117  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.46 
 
 
424 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000975107  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.19 
 
 
459 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0516461  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>