More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26430 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_26430  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
427 aa  841    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0524422  normal  0.366699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1101  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  64.37 
 
 
432 aa  512  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0746  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  66 
 
 
467 aa  509  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0939  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  64.75 
 
 
412 aa  496  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22970  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  58.07 
 
 
479 aa  473  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.776819  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  62.34 
 
 
427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.618779  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0968  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  63.54 
 
 
421 aa  467  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.315378  hitchhiker  0.000127982 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20410  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  54.39 
 
 
413 aa  418  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.586183  normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0878  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.75 
 
 
417 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8274  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  52.14 
 
 
422 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2550  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  53.88 
 
 
448 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5539  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  52.08 
 
 
414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31500  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  54.27 
 
 
419 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208804  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0823  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  56.62 
 
 
400 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1006  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  53.42 
 
 
406 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795132  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0127  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  52.53 
 
 
410 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40242  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1089  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.03 
 
 
403 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0708461  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2835  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.86 
 
 
428 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0519996  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3880  exodeoxyribonuclease VII large subunit  54.29 
 
 
416 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.52 
 
 
416 aa  379  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128369  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0468  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.16 
 
 
406 aa  378  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4107  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.02 
 
 
411 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0846  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.77 
 
 
401 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4338  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.27 
 
 
411 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.122512 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.02 
 
 
411 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3116  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  52.99 
 
 
425 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149038  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1074  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.13 
 
 
411 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8482  Exodeoxyribonuclease VII  51.89 
 
 
402 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1678  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51.25 
 
 
409 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.51 
 
 
402 aa  368  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11130  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.41 
 
 
415 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2077  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.12 
 
 
415 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172367  normal  0.206552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0727  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  53.85 
 
 
420 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4633  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.37 
 
 
410 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172446  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4389  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51.32 
 
 
432 aa  361  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16320  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.24 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1928  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.5 
 
 
452 aa  348  1e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0429  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  47.24 
 
 
491 aa  345  8e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000348661 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.13 
 
 
393 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.73 
 
 
406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.16 
 
 
403 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.33 
 
 
402 aa  216  8e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.5 
 
 
393 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.62 
 
 
458 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.75 
 
 
411 aa  200  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.56 
 
 
398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.66 
 
 
397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.25 
 
 
448 aa  197  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.11 
 
 
414 aa  196  6e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.11 
 
 
414 aa  196  6e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.84 
 
 
404 aa  194  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.25 
 
 
400 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.79 
 
 
455 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.08 
 
 
423 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.77 
 
 
451 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.17 
 
 
454 aa  189  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.46 
 
 
407 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.49 
 
 
463 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.13 
 
 
476 aa  187  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  31.48 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.82 
 
 
447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6807  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.98 
 
 
501 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0976698  normal  0.286525 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0430  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.62 
 
 
414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  27.85 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4330  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.32 
 
 
548 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554584  normal  0.651535 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30 
 
 
443 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.29 
 
 
444 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0262  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.3 
 
 
427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.32 
 
 
443 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.69 
 
 
459 aa  183  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.85 
 
 
448 aa  183  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.44 
 
 
446 aa  183  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.27 
 
 
407 aa  183  6e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.02 
 
 
461 aa  182  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.42 
 
 
402 aa  182  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33 
 
 
398 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.57 
 
 
453 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27 
 
 
451 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.57 
 
 
445 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.21 
 
 
463 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3211  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.91 
 
 
450 aa  180  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173866  normal  0.203327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.28 
 
 
446 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1670  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.38 
 
 
401 aa  179  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.41 
 
 
406 aa  179  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.75 
 
 
449 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.75 
 
 
449 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.97 
 
 
448 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.46 
 
 
459 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.71 
 
 
456 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.18 
 
 
405 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.97 
 
 
396 aa  178  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.5 
 
 
465 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.75 
 
 
449 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.71 
 
 
456 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.95 
 
 
458 aa  177  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2514  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.19 
 
 
401 aa  177  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1002  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.63 
 
 
454 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000181465  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.06 
 
 
462 aa  177  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.81 
 
 
458 aa  177  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000130865  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1753  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.61 
 
 
407 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.198539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>