More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4633 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2077  exodeoxyribonuclease VII large subunit  88.43 
 
 
415 aa  709    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172367  normal  0.206552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4633  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
410 aa  809    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172446  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11130  exodeoxyribonuclease VII large subunit  75.25 
 
 
415 aa  630  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4107  exodeoxyribonuclease VII large subunit  77.83 
 
 
411 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  77.83 
 
 
411 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4338  exodeoxyribonuclease VII large subunit  77.59 
 
 
411 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.122512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0727  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  61.25 
 
 
420 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3116  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  61.76 
 
 
425 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1678  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  63.21 
 
 
409 aa  456  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31500  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  59.19 
 
 
419 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208804  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0878  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.83 
 
 
417 aa  429  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8274  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  54.57 
 
 
422 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0823  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.81 
 
 
400 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4389  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.26 
 
 
432 aa  398  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5539  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  52.76 
 
 
414 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  54.14 
 
 
402 aa  398  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  52.81 
 
 
427 aa  392  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.618779  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8482  Exodeoxyribonuclease VII  53.54 
 
 
402 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1006  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  52.85 
 
 
406 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1074  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.36 
 
 
411 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0939  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.12 
 
 
412 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0127  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  52.5 
 
 
410 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40242  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0468  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.87 
 
 
406 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26430  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.37 
 
 
427 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0524422  normal  0.366699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3880  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.39 
 
 
416 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1089  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51.62 
 
 
403 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0708461  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0846  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.25 
 
 
401 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1101  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.76 
 
 
432 aa  358  9.999999999999999e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0968  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  48.87 
 
 
421 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.315378  hitchhiker  0.000127982 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.88 
 
 
416 aa  350  3e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128369  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0746  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.76 
 
 
467 aa  345  1e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22970  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.62 
 
 
479 aa  336  5.999999999999999e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.776819  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2550  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  46.93 
 
 
448 aa  332  6e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306428 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2835  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.44 
 
 
428 aa  330  4e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0519996  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20410  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.01 
 
 
413 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.586183  normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16320  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.38 
 
 
437 aa  300  4e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0429  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41 
 
 
491 aa  262  6e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000348661 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1928  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.34 
 
 
452 aa  258  1e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.33 
 
 
414 aa  206  7e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.33 
 
 
414 aa  206  7e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.56 
 
 
400 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.1 
 
 
402 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.1 
 
 
407 aa  199  6e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.73 
 
 
404 aa  199  9e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.72 
 
 
411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.36 
 
 
397 aa  196  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.49 
 
 
448 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.92 
 
 
407 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.76 
 
 
393 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.38 
 
 
398 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.55 
 
 
406 aa  192  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0430  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.19 
 
 
414 aa  190  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.03 
 
 
423 aa  190  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  30.57 
 
 
450 aa  189  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.61 
 
 
458 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.59 
 
 
454 aa  189  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.89 
 
 
467 aa  188  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.61 
 
 
400 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0888  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.57 
 
 
443 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.5 
 
 
451 aa  187  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.21 
 
 
452 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1753  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.38 
 
 
407 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.198539 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.23 
 
 
446 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.34 
 
 
400 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.76 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.07 
 
 
458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  29.16 
 
 
405 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.41 
 
 
384 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1979  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.01 
 
 
414 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337025  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.31 
 
 
463 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1774  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.22 
 
 
457 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.774071  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.05 
 
 
407 aa  181  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000325061  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.39 
 
 
463 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.16 
 
 
447 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.19 
 
 
406 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.79 
 
 
456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.98 
 
 
457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1002  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.29 
 
 
454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000181465  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.79 
 
 
456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.82 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1309  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.36 
 
 
398 aa  180  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0857  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.96 
 
 
443 aa  180  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.04 
 
 
456 aa  180  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.72 
 
 
463 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.71 
 
 
403 aa  179  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.41 
 
 
476 aa  179  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.57 
 
 
443 aa  179  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.27 
 
 
452 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.27 
 
 
452 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.27 
 
 
452 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.27 
 
 
452 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.48 
 
 
444 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.33 
 
 
443 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.09 
 
 
469 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.27 
 
 
452 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.55 
 
 
449 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.37 
 
 
446 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.49 
 
 
453 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.55 
 
 
449 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1536  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.07 
 
 
401 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0037923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>