More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1678 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1678  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  100 
 
 
409 aa  793    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2077  exodeoxyribonuclease VII large subunit  64.2 
 
 
415 aa  487  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172367  normal  0.206552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4633  exodeoxyribonuclease VII large subunit  63.21 
 
 
410 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172446  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11130  exodeoxyribonuclease VII large subunit  60.1 
 
 
415 aa  473  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4338  exodeoxyribonuclease VII large subunit  61.63 
 
 
411 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.122512 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4107  exodeoxyribonuclease VII large subunit  61.63 
 
 
411 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  61.63 
 
 
411 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3116  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  60.75 
 
 
425 aa  448  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149038  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31500  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  59.51 
 
 
419 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208804  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0727  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  60 
 
 
420 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0878  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.58 
 
 
417 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5539  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  52.61 
 
 
414 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1006  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  53.03 
 
 
406 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0823  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  54.73 
 
 
400 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26430  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.25 
 
 
427 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0524422  normal  0.366699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8274  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.5 
 
 
422 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  54.29 
 
 
427 aa  388  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.618779  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1074  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.07 
 
 
411 aa  383  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0846  exodeoxyribonuclease VII large subunit  55.05 
 
 
401 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3880  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.96 
 
 
416 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.9 
 
 
402 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0127  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  52.24 
 
 
410 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40242  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0939  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.75 
 
 
412 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0468  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.35 
 
 
406 aa  361  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8482  Exodeoxyribonuclease VII  51.14 
 
 
402 aa  359  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.49 
 
 
416 aa  350  2e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128369  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4389  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  53.28 
 
 
432 aa  349  5e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1101  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51.21 
 
 
432 aa  348  1e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1089  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51.12 
 
 
403 aa  346  5e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0708461  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22970  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.96 
 
 
479 aa  339  4e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.776819  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0746  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  49.62 
 
 
467 aa  338  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2550  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  48.66 
 
 
448 aa  334  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0968  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  48.87 
 
 
421 aa  332  7.000000000000001e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.315378  hitchhiker  0.000127982 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20410  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.82 
 
 
413 aa  323  3e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.586183  normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2835  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.28 
 
 
428 aa  317  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0519996  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16320  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.61 
 
 
437 aa  278  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1928  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.39 
 
 
452 aa  271  1e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0429  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.42 
 
 
491 aa  259  4e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000348661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.27 
 
 
393 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.95 
 
 
407 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.32 
 
 
407 aa  203  5e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.34 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.17 
 
 
411 aa  199  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.67 
 
 
414 aa  199  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.67 
 
 
414 aa  199  9e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.53 
 
 
404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.81 
 
 
448 aa  195  9e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.6 
 
 
469 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.05 
 
 
393 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1309  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.5 
 
 
398 aa  194  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.03 
 
 
448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.92 
 
 
397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.29 
 
 
458 aa  189  8e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.51 
 
 
423 aa  189  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1753  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.52 
 
 
407 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.198539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.12 
 
 
451 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1017  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.06 
 
 
398 aa  186  6e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  30.28 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1979  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.84 
 
 
414 aa  184  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337025  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.25 
 
 
476 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0430  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.4 
 
 
414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.56 
 
 
458 aa  182  7e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.48 
 
 
446 aa  182  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.2 
 
 
384 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2514  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.58 
 
 
401 aa  182  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.13 
 
 
455 aa  180  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0888  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.48 
 
 
443 aa  179  7e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1603  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.4 
 
 
410 aa  179  8e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.38 
 
 
456 aa  179  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0262  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.68 
 
 
427 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.81 
 
 
398 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.63 
 
 
463 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.55 
 
 
459 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.78 
 
 
422 aa  178  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000320124  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.84 
 
 
463 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.93 
 
 
463 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.41 
 
 
400 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.1 
 
 
398 aa  176  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1774  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.04 
 
 
457 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.774071  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.3 
 
 
400 aa  176  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1002  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.87 
 
 
454 aa  176  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000181465  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.64 
 
 
405 aa  176  9e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.14 
 
 
467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.01 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.1 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.68 
 
 
403 aa  173  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2064  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.64 
 
 
403 aa  173  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.63 
 
 
444 aa  173  5.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3117  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.89 
 
 
424 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000975107  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  29.76 
 
 
452 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0529  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.66 
 
 
419 aa  171  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0857  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.12 
 
 
443 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1536  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.23 
 
 
401 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0037923  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.46 
 
 
407 aa  170  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000325061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1582  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.95 
 
 
445 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117148  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1615  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.95 
 
 
445 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000193789  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0315  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.58 
 
 
406 aa  170  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.44 
 
 
445 aa  169  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.32 
 
 
408 aa  169  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.83 
 
 
454 aa  169  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>