More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31500 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_31500  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
419 aa  816    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208804  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0727  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  67.17 
 
 
420 aa  500  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5539  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  60 
 
 
414 aa  460  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0878  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  61.52 
 
 
417 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11130  exodeoxyribonuclease VII large subunit  59.26 
 
 
415 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2077  exodeoxyribonuclease VII large subunit  59.45 
 
 
415 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172367  normal  0.206552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0823  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  61.24 
 
 
400 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4633  exodeoxyribonuclease VII large subunit  59.19 
 
 
410 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172446  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3116  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  59.22 
 
 
425 aa  433  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149038  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  58.52 
 
 
402 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1678  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  59.51 
 
 
409 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4389  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  58.37 
 
 
432 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8274  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.97 
 
 
422 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8482  Exodeoxyribonuclease VII  56.14 
 
 
402 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26430  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  54.27 
 
 
427 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0524422  normal  0.366699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4338  exodeoxyribonuclease VII large subunit  56.68 
 
 
411 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.122512 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4107  exodeoxyribonuclease VII large subunit  56.68 
 
 
411 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  56.68 
 
 
411 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1089  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  58.81 
 
 
403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0708461  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0468  exodeoxyribonuclease VII large subunit  56.93 
 
 
406 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0846  exodeoxyribonuclease VII large subunit  59.55 
 
 
401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0127  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.53 
 
 
410 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40242  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3880  exodeoxyribonuclease VII large subunit  57.79 
 
 
416 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1006  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  56.17 
 
 
406 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1074  exodeoxyribonuclease VII large subunit  56.19 
 
 
411 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  54.15 
 
 
427 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.618779  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0939  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  53.06 
 
 
412 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  57.93 
 
 
416 aa  386  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128369  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1101  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50 
 
 
432 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22970  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.12 
 
 
479 aa  365  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.776819  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20410  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.12 
 
 
413 aa  363  3e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.586183  normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2550  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  49.5 
 
 
448 aa  350  3e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306428 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0746  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51.61 
 
 
467 aa  347  3e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0968  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.75 
 
 
421 aa  346  5e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.315378  hitchhiker  0.000127982 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2835  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.26 
 
 
428 aa  341  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0519996  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16320  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.87 
 
 
437 aa  301  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1928  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.61 
 
 
452 aa  298  8e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0429  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.47 
 
 
491 aa  298  1e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000348661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.18 
 
 
393 aa  219  8.999999999999998e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.53 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.89 
 
 
414 aa  202  9e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.15 
 
 
411 aa  199  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.32 
 
 
403 aa  199  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.36 
 
 
414 aa  199  7e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.71 
 
 
400 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.19 
 
 
469 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.84 
 
 
476 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.81 
 
 
453 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  32.29 
 
 
405 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.42 
 
 
402 aa  194  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.29 
 
 
446 aa  193  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.71 
 
 
398 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.13 
 
 
423 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.32 
 
 
404 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.14 
 
 
455 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.64 
 
 
458 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.37 
 
 
448 aa  190  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0430  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.85 
 
 
414 aa  189  5.999999999999999e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.4 
 
 
463 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.92 
 
 
458 aa  188  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.49 
 
 
397 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.47 
 
 
406 aa  187  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.25 
 
 
456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.63 
 
 
443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.76 
 
 
407 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1979  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.74 
 
 
414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337025  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1309  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.83 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.68 
 
 
463 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.4 
 
 
443 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.48 
 
 
398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.9 
 
 
459 aa  183  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6807  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.52 
 
 
501 aa  182  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0976698  normal  0.286525 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.84 
 
 
451 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0888  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.82 
 
 
443 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.07 
 
 
448 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.33 
 
 
447 aa  180  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.68 
 
 
402 aa  180  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.95 
 
 
459 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.83 
 
 
463 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4728  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.77 
 
 
392 aa  179  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.94 
 
 
467 aa  179  9e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1615  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.31 
 
 
445 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000193789  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1582  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.31 
 
 
445 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117148  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.79 
 
 
448 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.24 
 
 
400 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.32 
 
 
400 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.93 
 
 
446 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.28 
 
 
452 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.28 
 
 
452 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.38 
 
 
396 aa  177  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.28 
 
 
452 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.28 
 
 
452 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.05 
 
 
452 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.28 
 
 
452 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.94 
 
 
463 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.05 
 
 
452 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15230  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.78 
 
 
459 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173867  hitchhiker  0.000000000874033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.4 
 
 
463 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.51 
 
 
445 aa  177  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.15 
 
 
406 aa  176  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>