More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1089 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1089  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  100 
 
 
403 aa  774    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0708461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8482  Exodeoxyribonuclease VII  71.83 
 
 
402 aa  551  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  68.84 
 
 
402 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0127  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  70.78 
 
 
410 aa  528  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40242  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0468  exodeoxyribonuclease VII large subunit  70.6 
 
 
406 aa  514  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3880  exodeoxyribonuclease VII large subunit  61.44 
 
 
416 aa  450  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0846  exodeoxyribonuclease VII large subunit  60.75 
 
 
401 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8274  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  58.79 
 
 
422 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1006  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  59.49 
 
 
406 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795132  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0878  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  59.95 
 
 
417 aa  436  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0823  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  61.2 
 
 
400 aa  429  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1074  exodeoxyribonuclease VII large subunit  58.96 
 
 
411 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5539  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  57.65 
 
 
414 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  60.44 
 
 
416 aa  418  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128369  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31500  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  58.81 
 
 
419 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208804  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26430  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  55.03 
 
 
427 aa  403  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0524422  normal  0.366699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0939  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.03 
 
 
412 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22970  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  54.94 
 
 
479 aa  393  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.776819  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0727  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  56.64 
 
 
420 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11130  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.07 
 
 
415 aa  385  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.75 
 
 
427 aa  388  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.618779  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3116  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.11 
 
 
425 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149038  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1101  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51.78 
 
 
432 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20410  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.87 
 
 
413 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.586183  normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0746  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.36 
 
 
467 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2077  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.87 
 
 
415 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172367  normal  0.206552 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0968  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  52.93 
 
 
421 aa  369  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.315378  hitchhiker  0.000127982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4338  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.01 
 
 
411 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.122512 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2550  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.61 
 
 
448 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306428 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4107  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.76 
 
 
411 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.76 
 
 
411 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4633  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.62 
 
 
410 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172446  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2835  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.75 
 
 
428 aa  361  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0519996  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4389  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  52.74 
 
 
432 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1678  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51.12 
 
 
409 aa  345  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16320  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  51 
 
 
437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0429  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.5 
 
 
491 aa  315  7e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000348661 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1928  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.78 
 
 
452 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.86 
 
 
393 aa  233  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.95 
 
 
393 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.75 
 
 
406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.65 
 
 
414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.65 
 
 
414 aa  213  5.999999999999999e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.1 
 
 
397 aa  210  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1979  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.54 
 
 
414 aa  209  8e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.25 
 
 
403 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.87 
 
 
398 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0262  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.28 
 
 
427 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  34.33 
 
 
405 aa  204  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.52 
 
 
404 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.36 
 
 
448 aa  203  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.54 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1915  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.52 
 
 
471 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.87 
 
 
400 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.83 
 
 
411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.05 
 
 
398 aa  195  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.92 
 
 
476 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0888  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.18 
 
 
443 aa  194  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.07 
 
 
461 aa  193  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.93 
 
 
447 aa  192  7e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.9 
 
 
384 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.46 
 
 
464 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.54 
 
 
453 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.68 
 
 
458 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.46 
 
 
462 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0641  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.32 
 
 
449 aa  191  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.782635  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.48 
 
 
407 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3117  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.62 
 
 
424 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000975107  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0430  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.33 
 
 
414 aa  189  7e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.21 
 
 
451 aa  189  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.47 
 
 
463 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.91 
 
 
458 aa  189  8e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.7 
 
 
467 aa  189  9e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.78 
 
 
407 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.9 
 
 
457 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.25 
 
 
456 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000149221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.25 
 
 
456 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000102008  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  33.49 
 
 
452 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.18 
 
 
448 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  31.25 
 
 
456 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000142965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.25 
 
 
456 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.25 
 
 
456 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.43 
 
 
449 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1670  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.12 
 
 
401 aa  187  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014352  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0529  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.76 
 
 
419 aa  186  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.43 
 
 
449 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.56 
 
 
446 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.66 
 
 
402 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.43 
 
 
449 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.01 
 
 
456 aa  186  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1309  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.5 
 
 
398 aa  186  6e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.56 
 
 
396 aa  186  7e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.87 
 
 
408 aa  186  9e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0857  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.95 
 
 
443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.31 
 
 
463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.19 
 
 
449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.95 
 
 
449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.12 
 
 
407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000325061  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.31 
 
 
444 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1774  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.56 
 
 
457 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.774071  normal  0.392966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>