More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5539 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5539  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  100 
 
 
414 aa  816    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0878  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  65.91 
 
 
417 aa  503  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0823  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  62.44 
 
 
400 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31500  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  60 
 
 
419 aa  450  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208804  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0846  exodeoxyribonuclease VII large subunit  59.69 
 
 
401 aa  435  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3880  exodeoxyribonuclease VII large subunit  59.45 
 
 
416 aa  433  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8274  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  56.53 
 
 
422 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0468  exodeoxyribonuclease VII large subunit  59.3 
 
 
406 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  57.61 
 
 
402 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1006  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  56.14 
 
 
406 aa  424  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795132  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0127  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  57.18 
 
 
410 aa  421  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40242  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0727  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  57.36 
 
 
420 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.36 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.618779  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1074  exodeoxyribonuclease VII large subunit  57.4 
 
 
411 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0939  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  53.6 
 
 
412 aa  409  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1101  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51.35 
 
 
432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11130  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.22 
 
 
415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26430  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.08 
 
 
427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0524422  normal  0.366699 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22970  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.94 
 
 
479 aa  404  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.776819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8482  Exodeoxyribonuclease VII  55.84 
 
 
402 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20410  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.62 
 
 
413 aa  404  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.586183  normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0746  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  54.46 
 
 
467 aa  400  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3116  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  58.59 
 
 
425 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149038  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1089  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  57.65 
 
 
403 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0708461  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2077  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.03 
 
 
415 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172367  normal  0.206552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4633  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.74 
 
 
410 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172446  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  55.72 
 
 
416 aa  380  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128369  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4107  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.63 
 
 
411 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4338  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.88 
 
 
411 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.122512 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.63 
 
 
411 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1678  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  52.61 
 
 
409 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0968  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51.4 
 
 
421 aa  371  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.315378  hitchhiker  0.000127982 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4389  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51.23 
 
 
432 aa  371  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2550  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  49.02 
 
 
448 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306428 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2835  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.38 
 
 
428 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0519996  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16320  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.75 
 
 
437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0429  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.73 
 
 
491 aa  300  3e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000348661 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1928  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.11 
 
 
452 aa  292  8e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.52 
 
 
393 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.08 
 
 
393 aa  224  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.45 
 
 
458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.16 
 
 
423 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.7 
 
 
406 aa  212  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.41 
 
 
411 aa  210  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.1 
 
 
453 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.33 
 
 
398 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.32 
 
 
403 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.52 
 
 
448 aa  207  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.08 
 
 
414 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.38 
 
 
446 aa  206  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.6 
 
 
398 aa  206  7e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.81 
 
 
414 aa  206  8e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.85 
 
 
454 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.13 
 
 
400 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.19 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.17 
 
 
447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.25 
 
 
458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.71 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0315  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.51 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1017  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.1 
 
 
398 aa  200  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.25 
 
 
408 aa  201  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.93 
 
 
404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.89 
 
 
476 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  30.69 
 
 
405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0262  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.86 
 
 
427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  32.14 
 
 
452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.22 
 
 
469 aa  196  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1979  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.25 
 
 
414 aa  194  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337025  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.38 
 
 
402 aa  193  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0888  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.25 
 
 
443 aa  193  5e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.77 
 
 
445 aa  192  8e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4728  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.96 
 
 
392 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.44 
 
 
455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.04 
 
 
400 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.22 
 
 
463 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2804  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.14 
 
 
469 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345975  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.7 
 
 
396 aa  189  8e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.06 
 
 
461 aa  189  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2527  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.17 
 
 
440 aa  189  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.258922  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.04 
 
 
446 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2398  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.4 
 
 
467 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.28 
 
 
407 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.76 
 
 
407 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.98 
 
 
463 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2006  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.81 
 
 
444 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6807  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.86 
 
 
501 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0976698  normal  0.286525 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.92 
 
 
402 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.98 
 
 
384 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.37 
 
 
467 aa  187  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0857  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.29 
 
 
443 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1296  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.98 
 
 
442 aa  186  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430502  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.65 
 
 
463 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1002  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.91 
 
 
454 aa  186  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000181465  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.93 
 
 
406 aa  186  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.27 
 
 
451 aa  186  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.12 
 
 
454 aa  186  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2360  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.99 
 
 
447 aa  186  8e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.203365  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.98 
 
 
456 aa  186  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2064  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.87 
 
 
403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.93 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>