More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22970 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_22970  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
479 aa  929    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.776819  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26430  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  58.07 
 
 
427 aa  472  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0524422  normal  0.366699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1101  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  56.68 
 
 
432 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  59.66 
 
 
427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.618779  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0746  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  59.66 
 
 
467 aa  439  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0939  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  53.62 
 
 
412 aa  413  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0968  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  57.04 
 
 
421 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.315378  hitchhiker  0.000127982 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2550  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51.84 
 
 
448 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5539  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  53.94 
 
 
414 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0878  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  53.18 
 
 
417 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2835  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.99 
 
 
428 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0519996  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20410  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  54.9 
 
 
413 aa  385  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.586183  normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1089  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  54.94 
 
 
403 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0708461  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0127  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  53.35 
 
 
410 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40242  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1006  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51.24 
 
 
406 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795132  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0468  exodeoxyribonuclease VII large subunit  54.5 
 
 
406 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8274  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.13 
 
 
422 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.03 
 
 
402 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8482  Exodeoxyribonuclease VII  51.49 
 
 
402 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.07 
 
 
416 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128369  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0823  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51.64 
 
 
400 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1074  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.61 
 
 
411 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3880  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.64 
 
 
416 aa  363  3e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0846  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.04 
 
 
401 aa  362  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31500  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.12 
 
 
419 aa  361  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208804  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11130  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.89 
 
 
415 aa  349  5e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0727  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  49 
 
 
420 aa  341  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3116  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  49.88 
 
 
425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149038  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4107  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.68 
 
 
411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.68 
 
 
411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2077  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.56 
 
 
415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172367  normal  0.206552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4633  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.8 
 
 
410 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172446  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4338  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.68 
 
 
411 aa  326  6e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.122512 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16320  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.33 
 
 
437 aa  324  2e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4389  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  49.63 
 
 
432 aa  322  8e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1678  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  47.96 
 
 
409 aa  315  8e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0429  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.64 
 
 
491 aa  290  4e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000348661 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1928  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.86 
 
 
452 aa  288  2e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.16 
 
 
393 aa  224  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.27 
 
 
393 aa  213  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.87 
 
 
411 aa  207  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  34.52 
 
 
405 aa  205  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.42 
 
 
403 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.21 
 
 
400 aa  204  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.51 
 
 
398 aa  200  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.13 
 
 
406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.76 
 
 
448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.56 
 
 
455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.88 
 
 
458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.51 
 
 
414 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.25 
 
 
414 aa  193  6e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.02 
 
 
397 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.84 
 
 
404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.6 
 
 
476 aa  189  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.52 
 
 
447 aa  189  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.94 
 
 
405 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.57 
 
 
444 aa  187  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.72 
 
 
400 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.91 
 
 
402 aa  186  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.11 
 
 
407 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.17 
 
 
458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.18 
 
 
458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.87 
 
 
458 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.78 
 
 
398 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.64 
 
 
467 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.87 
 
 
423 aa  182  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.11 
 
 
446 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2085  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.3 
 
 
465 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.49 
 
 
407 aa  182  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.22 
 
 
400 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.58 
 
 
446 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.51 
 
 
459 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0516461  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.52 
 
 
448 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.61 
 
 
454 aa  179  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.78 
 
 
451 aa  179  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2006  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.71 
 
 
444 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1237  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.21 
 
 
404 aa  178  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.44 
 
 
452 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.98 
 
 
463 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.44 
 
 
452 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.61 
 
 
454 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.96 
 
 
461 aa  178  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.74 
 
 
453 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15230  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.22 
 
 
459 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173867  hitchhiker  0.000000000874033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3195  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.57 
 
 
459 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300243  normal  0.30831 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.18 
 
 
469 aa  177  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1979  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.63 
 
 
414 aa  177  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337025  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.16 
 
 
408 aa  177  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.9 
 
 
462 aa  176  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.54 
 
 
463 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.46 
 
 
455 aa  176  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.21 
 
 
452 aa  176  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.21 
 
 
452 aa  176  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0539  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.57 
 
 
459 aa  176  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1296  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.54 
 
 
442 aa  176  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430502  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.21 
 
 
452 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.21 
 
 
452 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.21 
 
 
452 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1339  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.99 
 
 
462 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.6 
 
 
456 aa  176  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>