More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1875 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
416 aa  808    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128369  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  59.8 
 
 
402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8274  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.47 
 
 
422 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8482  Exodeoxyribonuclease VII  57.54 
 
 
402 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0846  exodeoxyribonuclease VII large subunit  60.41 
 
 
401 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1089  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  61.27 
 
 
403 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0708461  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3880  exodeoxyribonuclease VII large subunit  59.55 
 
 
416 aa  434  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0878  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  58.59 
 
 
417 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0468  exodeoxyribonuclease VII large subunit  59.34 
 
 
406 aa  424  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0823  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  58.18 
 
 
400 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26430  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.38 
 
 
427 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0524422  normal  0.366699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31500  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  57.93 
 
 
419 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208804  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5539  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.78 
 
 
414 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0127  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  54.52 
 
 
410 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40242  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22970  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.22 
 
 
479 aa  397  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.776819  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1074  exodeoxyribonuclease VII large subunit  54.36 
 
 
411 aa  396  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  53.09 
 
 
427 aa  391  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.618779  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11130  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.87 
 
 
415 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0727  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.5 
 
 
420 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1006  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51.5 
 
 
406 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795132  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0939  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.76 
 
 
412 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2077  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.51 
 
 
415 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172367  normal  0.206552 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3116  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  54.59 
 
 
425 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149038  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4107  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.94 
 
 
411 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4338  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.2 
 
 
411 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.122512 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.94 
 
 
411 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4633  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.5 
 
 
410 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172446  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1101  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.13 
 
 
432 aa  362  5.0000000000000005e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0968  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.13 
 
 
421 aa  360  3e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.315378  hitchhiker  0.000127982 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20410  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.88 
 
 
413 aa  358  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.586183  normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1678  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51.49 
 
 
409 aa  351  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2550  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  47.96 
 
 
448 aa  339  5e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4389  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.74 
 
 
432 aa  338  8e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0746  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.25 
 
 
467 aa  336  5e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2835  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.31 
 
 
428 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0519996  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16320  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.87 
 
 
437 aa  306  3e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0429  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.93 
 
 
491 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000348661 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1928  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.45 
 
 
452 aa  263  4e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.16 
 
 
393 aa  234  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.27 
 
 
403 aa  226  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.14 
 
 
453 aa  226  8e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.97 
 
 
451 aa  224  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.7 
 
 
393 aa  224  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.89 
 
 
463 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.08 
 
 
463 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1979  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.63 
 
 
414 aa  218  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337025  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.84 
 
 
476 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.46 
 
 
448 aa  216  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  32.62 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.63 
 
 
451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.83 
 
 
404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.63 
 
 
396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0262  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.46 
 
 
427 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.43 
 
 
459 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.65 
 
 
463 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.16 
 
 
414 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.54 
 
 
414 aa  212  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.88 
 
 
408 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.74 
 
 
397 aa  210  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.68 
 
 
448 aa  211  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0430  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.94 
 
 
414 aa  210  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.34 
 
 
411 aa  210  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.6 
 
 
406 aa  209  6e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.26 
 
 
448 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.3 
 
 
469 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.6 
 
 
446 aa  208  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0315  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.72 
 
 
406 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.78 
 
 
398 aa  207  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.17 
 
 
456 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.29 
 
 
384 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.29 
 
 
407 aa  206  8e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000325061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.43 
 
 
458 aa  206  9e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3117  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.19 
 
 
424 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000975107  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.72 
 
 
467 aa  202  8e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.07 
 
 
398 aa  202  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.75 
 
 
447 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1017  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.42 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.4 
 
 
452 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.34 
 
 
405 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.09 
 
 
455 aa  201  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0752  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.03 
 
 
460 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.955357  normal  0.27096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1339  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.1 
 
 
462 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32 
 
 
443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0752  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.02 
 
 
456 aa  200  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0683823  hitchhiker  0.000291516 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.6 
 
 
459 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.94 
 
 
452 aa  199  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.94 
 
 
452 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.94 
 
 
452 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.94 
 
 
452 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.94 
 
 
452 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.94 
 
 
452 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6807  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.32 
 
 
501 aa  199  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0976698  normal  0.286525 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.38 
 
 
400 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.8 
 
 
443 aa  199  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.55 
 
 
446 aa  199  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000016399  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.58 
 
 
458 aa  199  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29 
 
 
452 aa  199  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15230  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.76 
 
 
459 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173867  hitchhiker  0.000000000874033 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.87 
 
 
407 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.89 
 
 
463 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>