More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0746 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0746  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  100 
 
 
467 aa  924    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26430  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  66 
 
 
427 aa  523  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0524422  normal  0.366699 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22970  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  59.66 
 
 
479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.776819  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1101  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  57.18 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0939  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  57.5 
 
 
412 aa  420  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.83 
 
 
427 aa  413  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.618779  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5539  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  54.46 
 
 
414 aa  411  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2550  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51.24 
 
 
448 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0968  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  54.27 
 
 
421 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.315378  hitchhiker  0.000127982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0878  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  53.43 
 
 
417 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2835  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.08 
 
 
428 aa  383  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0519996  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20410  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.22 
 
 
413 aa  381  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.586183  normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8274  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51 
 
 
422 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0127  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  52.61 
 
 
410 aa  372  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40242  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0468  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.92 
 
 
406 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0823  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  52.58 
 
 
400 aa  364  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1006  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.89 
 
 
406 aa  362  6e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795132  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1089  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.36 
 
 
403 aa  361  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0708461  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16320  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.84 
 
 
437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31500  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.61 
 
 
419 aa  355  8.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208804  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4633  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.76 
 
 
410 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172446  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2077  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50 
 
 
415 aa  353  5e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172367  normal  0.206552 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1074  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.25 
 
 
411 aa  352  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0846  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.03 
 
 
401 aa  349  7e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.89 
 
 
402 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11130  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.15 
 
 
415 aa  347  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3880  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.65 
 
 
416 aa  347  3e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4107  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.89 
 
 
411 aa  346  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.89 
 
 
411 aa  346  5e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4338  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.15 
 
 
411 aa  346  6e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.122512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8482  Exodeoxyribonuclease VII  51.03 
 
 
402 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0727  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50 
 
 
420 aa  340  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3116  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  49.04 
 
 
425 aa  335  9e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1678  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  49.25 
 
 
409 aa  333  4e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0429  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.47 
 
 
491 aa  332  9e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000348661 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1928  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.19 
 
 
452 aa  327  3e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4389  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  48.03 
 
 
432 aa  318  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.25 
 
 
416 aa  317  3e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128369  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.37 
 
 
393 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.75 
 
 
393 aa  206  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.25 
 
 
403 aa  204  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.9 
 
 
406 aa  202  8e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.04 
 
 
458 aa  199  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.02 
 
 
448 aa  199  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.63 
 
 
414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.63 
 
 
414 aa  199  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.54 
 
 
400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.16 
 
 
398 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.85 
 
 
397 aa  190  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.65 
 
 
402 aa  190  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.56 
 
 
423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.11 
 
 
411 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0430  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.13 
 
 
414 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  31.1 
 
 
452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.42 
 
 
398 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2527  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.04 
 
 
440 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.258922  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.31 
 
 
447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.42 
 
 
405 aa  180  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1002  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.68 
 
 
454 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000181465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.37 
 
 
404 aa  180  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6807  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.02 
 
 
501 aa  179  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0976698  normal  0.286525 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.14 
 
 
400 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.17 
 
 
407 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.14 
 
 
400 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0752  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32 
 
 
460 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.955357  normal  0.27096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.46 
 
 
454 aa  177  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2462  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.66 
 
 
460 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422545 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2085  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.58 
 
 
465 aa  176  7e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.82 
 
 
455 aa  176  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.66 
 
 
460 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144595  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.3 
 
 
455 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.55 
 
 
448 aa  176  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.56 
 
 
407 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1732  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.54 
 
 
480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.709367  hitchhiker  0.00631476 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.07 
 
 
461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.51 
 
 
446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1979  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.25 
 
 
414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337025  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.38 
 
 
456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.38 
 
 
456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06250  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.92 
 
 
456 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0960619  hitchhiker  0.006008 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0029  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.92 
 
 
388 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0282686  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0056  putative exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.27 
 
 
388 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.45 
 
 
446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  29.49 
 
 
405 aa  173  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.05 
 
 
465 aa  173  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.17 
 
 
451 aa  173  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2006  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.58 
 
 
444 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.76 
 
 
443 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.43 
 
 
460 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782017  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.13 
 
 
454 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1017  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.55 
 
 
398 aa  172  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0539  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.98 
 
 
459 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.95 
 
 
458 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0888  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.06 
 
 
443 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.02 
 
 
510 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00935981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0929  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.24 
 
 
460 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.344174  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0567  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.8 
 
 
510 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0175948  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2272  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.02 
 
 
460 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00826344  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1044  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.02 
 
 
460 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000021456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2149  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.02 
 
 
460 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>