More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3067 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
402 aa  789    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8482  Exodeoxyribonuclease VII  83.33 
 
 
402 aa  664    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0468  exodeoxyribonuclease VII large subunit  69.58 
 
 
406 aa  520  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0127  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  68.1 
 
 
410 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40242  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1089  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  68.84 
 
 
403 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0708461  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3880  exodeoxyribonuclease VII large subunit  61.56 
 
 
416 aa  448  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0846  exodeoxyribonuclease VII large subunit  61.48 
 
 
401 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1006  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  56.93 
 
 
406 aa  443  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795132  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0878  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  60.77 
 
 
417 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1074  exodeoxyribonuclease VII large subunit  58.84 
 
 
411 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8274  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  56.47 
 
 
422 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5539  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  57.61 
 
 
414 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0823  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  60.58 
 
 
400 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31500  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  58.52 
 
 
419 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208804  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  59.2 
 
 
416 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128369  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0727  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.86 
 
 
420 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11130  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.32 
 
 
415 aa  391  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  52.72 
 
 
427 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.618779  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4633  exodeoxyribonuclease VII large subunit  54.14 
 
 
410 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172446  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0939  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  53.35 
 
 
412 aa  381  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4338  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.16 
 
 
411 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.122512 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4107  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.91 
 
 
411 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.91 
 
 
411 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3116  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  55.83 
 
 
425 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149038  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22970  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.03 
 
 
479 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.776819  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2077  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.25 
 
 
415 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172367  normal  0.206552 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26430  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.51 
 
 
427 aa  368  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0524422  normal  0.366699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4389  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  52.38 
 
 
432 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20410  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.38 
 
 
413 aa  363  3e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.586183  normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2550  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.36 
 
 
448 aa  356  5e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306428 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1101  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.39 
 
 
432 aa  355  5.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0968  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.9 
 
 
421 aa  354  2e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.315378  hitchhiker  0.000127982 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2835  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.87 
 
 
428 aa  348  8e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0519996  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1678  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51.9 
 
 
409 aa  344  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0746  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.89 
 
 
467 aa  333  3e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16320  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.11 
 
 
437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0429  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.96 
 
 
491 aa  300  2e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000348661 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1928  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.41 
 
 
452 aa  288  1e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.23 
 
 
393 aa  232  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.42 
 
 
393 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.36 
 
 
398 aa  223  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.7 
 
 
397 aa  221  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.19 
 
 
398 aa  219  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1979  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.57 
 
 
414 aa  216  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.42 
 
 
403 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.08 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.89 
 
 
476 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.21 
 
 
414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.21 
 
 
414 aa  213  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.16 
 
 
406 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.81 
 
 
448 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0262  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.24 
 
 
427 aa  209  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.42 
 
 
404 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.9 
 
 
411 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.42 
 
 
396 aa  207  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.55 
 
 
458 aa  206  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.33 
 
 
400 aa  203  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4244  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30 
 
 
444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.59 
 
 
458 aa  201  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.77 
 
 
407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0430  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.42 
 
 
414 aa  199  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.07 
 
 
384 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  32.72 
 
 
405 aa  197  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.38 
 
 
451 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.09 
 
 
444 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.47 
 
 
402 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.77 
 
 
454 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.83 
 
 
461 aa  196  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.87 
 
 
408 aa  196  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.59 
 
 
407 aa  196  7e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0752  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.71 
 
 
456 aa  196  8.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0683823  hitchhiker  0.000291516 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.53 
 
 
469 aa  196  9e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0315  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.77 
 
 
406 aa  196  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.73 
 
 
402 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0641  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30 
 
 
449 aa  195  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.782635  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.12 
 
 
463 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.39 
 
 
463 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.24 
 
 
405 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6807  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.73 
 
 
501 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0976698  normal  0.286525 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.42 
 
 
447 aa  194  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1017  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.39 
 
 
398 aa  193  5e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3211  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.94 
 
 
450 aa  193  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173866  normal  0.203327 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.04 
 
 
448 aa  193  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.62 
 
 
463 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3117  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.17 
 
 
424 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000975107  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.82 
 
 
462 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.81 
 
 
446 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.29 
 
 
464 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.41 
 
 
467 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  32.13 
 
 
452 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1670  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.01 
 
 
401 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.65 
 
 
400 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.12 
 
 
449 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.82 
 
 
458 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.27 
 
 
443 aa  190  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.19 
 
 
423 aa  189  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.82 
 
 
458 aa  189  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0529  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.58 
 
 
419 aa  189  9e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.63 
 
 
455 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.63 
 
 
456 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>