More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0529 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0529  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  100 
 
 
419 aa  847    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1979  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  56 
 
 
414 aa  442  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337025  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1893  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  54.85 
 
 
424 aa  424  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.185054 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3009  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.29 
 
 
472 aa  365  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1280  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.89 
 
 
458 aa  298  2e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.320775 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.53 
 
 
405 aa  282  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.94 
 
 
407 aa  281  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000325061  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.79 
 
 
414 aa  273  4.0000000000000004e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.53 
 
 
414 aa  271  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.95 
 
 
404 aa  268  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.06 
 
 
400 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.06 
 
 
400 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.79 
 
 
411 aa  263  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1309  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.44 
 
 
398 aa  261  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.69 
 
 
423 aa  259  8e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.65 
 
 
406 aa  258  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.61 
 
 
407 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.39 
 
 
459 aa  256  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.13 
 
 
469 aa  256  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.01 
 
 
453 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.9 
 
 
402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.54 
 
 
403 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40 
 
 
402 aa  252  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.76 
 
 
463 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4728  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.13 
 
 
392 aa  250  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.87 
 
 
406 aa  250  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.39 
 
 
407 aa  250  4e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.6 
 
 
448 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.5 
 
 
398 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1017  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.05 
 
 
398 aa  246  8e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.06 
 
 
443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.82 
 
 
443 aa  243  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2078  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.96 
 
 
402 aa  243  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.28 
 
 
476 aa  243  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6807  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.36 
 
 
501 aa  242  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0976698  normal  0.286525 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2514  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.59 
 
 
401 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.09 
 
 
393 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.78 
 
 
398 aa  239  5e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.93 
 
 
396 aa  239  6.999999999999999e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  36.9 
 
 
405 aa  239  9e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1719  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.45 
 
 
454 aa  238  1e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.623668  hitchhiker  0.0000296907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.57 
 
 
463 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.15 
 
 
451 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1753  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.83 
 
 
407 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.198539 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3211  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.34 
 
 
450 aa  237  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173866  normal  0.203327 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1216  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.63 
 
 
448 aa  237  3e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0401789  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.3 
 
 
459 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2037  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.66 
 
 
465 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.2 
 
 
465 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.59 
 
 
454 aa  236  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.32 
 
 
452 aa  235  9e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.07 
 
 
463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.32 
 
 
452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.32 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.32 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.32 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.32 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.32 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.32 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.32 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.83 
 
 
458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.68 
 
 
467 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.88 
 
 
463 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.32 
 
 
452 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.84 
 
 
463 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1670  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.66 
 
 
401 aa  232  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014352  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.95 
 
 
393 aa  232  9e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.92 
 
 
400 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0029  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.17 
 
 
388 aa  232  1e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0282686  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0262  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.72 
 
 
427 aa  232  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.08 
 
 
461 aa  232  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.81 
 
 
455 aa  232  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.77 
 
 
475 aa  232  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.4 
 
 
446 aa  232  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0315  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.24 
 
 
406 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3117  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.62 
 
 
424 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000975107  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1037  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.78 
 
 
397 aa  231  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0524439  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0340  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.4 
 
 
402 aa  230  3e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.194852 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.91 
 
 
456 aa  230  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.57 
 
 
453 aa  230  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.1 
 
 
449 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.1 
 
 
449 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.98 
 
 
449 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.5 
 
 
408 aa  230  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2413  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.64 
 
 
402 aa  229  5e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1413  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.24 
 
 
496 aa  229  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.38 
 
 
458 aa  229  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1331  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.79 
 
 
462 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.701446  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.77 
 
 
455 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.09 
 
 
444 aa  229  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0281  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.59 
 
 
417 aa  229  1e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.396563  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.43 
 
 
449 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.15 
 
 
457 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl331  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.74 
 
 
404 aa  228  2e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1582  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.58 
 
 
445 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117148  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1615  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.58 
 
 
445 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000193789  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30 
 
 
445 aa  226  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.83026  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.2 
 
 
449 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.67 
 
 
462 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.78 
 
 
458 aa  226  4e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>