More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1928 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1928  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
452 aa  920    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0429  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  68.69 
 
 
491 aa  598  1e-170  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000348661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26430  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.03 
 
 
427 aa  355  7.999999999999999e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0524422  normal  0.366699 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0746  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.21 
 
 
467 aa  319  5e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0939  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  45.54 
 
 
412 aa  318  1e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.46 
 
 
427 aa  316  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.618779  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1101  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  45.74 
 
 
432 aa  313  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0878  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.44 
 
 
417 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8274  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.69 
 
 
422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1089  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.5 
 
 
403 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0708461  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0968  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  45.79 
 
 
421 aa  299  7e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.315378  hitchhiker  0.000127982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0823  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.04 
 
 
400 aa  296  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5539  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.04 
 
 
414 aa  293  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8482  Exodeoxyribonuclease VII  43.69 
 
 
402 aa  292  9e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31500  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.64 
 
 
419 aa  290  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208804  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.36 
 
 
402 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2550  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.65 
 
 
448 aa  290  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306428 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22970  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.34 
 
 
479 aa  289  7e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.776819  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0127  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.67 
 
 
410 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40242  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1074  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.43 
 
 
411 aa  287  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0727  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.2 
 
 
420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1006  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.74 
 
 
406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795132  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16320  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.42 
 
 
437 aa  279  7e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20410  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.2 
 
 
413 aa  277  3e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.586183  normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0468  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.36 
 
 
406 aa  273  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3116  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.21 
 
 
425 aa  265  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149038  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0846  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.16 
 
 
401 aa  263  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4633  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.45 
 
 
410 aa  259  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172446  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4389  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.8 
 
 
432 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2835  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.51 
 
 
428 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0519996  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11130  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.96 
 
 
415 aa  258  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2077  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.25 
 
 
415 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172367  normal  0.206552 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4107  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.96 
 
 
411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1678  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.08 
 
 
409 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4338  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.21 
 
 
411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.122512 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.96 
 
 
411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3880  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40 
 
 
416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.26 
 
 
416 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128369  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.99 
 
 
397 aa  213  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.24 
 
 
393 aa  209  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.89 
 
 
393 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.03 
 
 
458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.98 
 
 
402 aa  201  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.83 
 
 
403 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.97 
 
 
406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32 
 
 
398 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.25 
 
 
447 aa  194  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.79 
 
 
398 aa  190  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  31.21 
 
 
452 aa  189  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.73 
 
 
414 aa  189  7e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.86 
 
 
407 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.77 
 
 
454 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.64 
 
 
453 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.46 
 
 
414 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.89 
 
 
455 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.75 
 
 
407 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.04 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.43 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0315  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.82 
 
 
406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.91 
 
 
458 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.5 
 
 
406 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.95 
 
 
400 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.51 
 
 
451 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.46 
 
 
463 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.33 
 
 
404 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1979  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.68 
 
 
414 aa  179  8e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337025  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1753  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.86 
 
 
407 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.198539 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.85 
 
 
408 aa  178  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2302  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.69 
 
 
445 aa  178  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.46 
 
 
457 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1557  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.69 
 
 
445 aa  178  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.36 
 
 
411 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1511  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.05 
 
 
451 aa  177  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.823365  normal  0.344595 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  29.67 
 
 
405 aa  177  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.83 
 
 
452 aa  177  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.83 
 
 
452 aa  177  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0262  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.13 
 
 
427 aa  177  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.83 
 
 
452 aa  177  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.43 
 
 
458 aa  177  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.45 
 
 
448 aa  177  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.83 
 
 
452 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.88 
 
 
475 aa  177  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.83 
 
 
452 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.83 
 
 
452 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.83 
 
 
452 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.83 
 
 
452 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.83 
 
 
452 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.51 
 
 
384 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.75 
 
 
463 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.5 
 
 
454 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4728  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35 
 
 
392 aa  176  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1719  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.77 
 
 
454 aa  176  8e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.623668  hitchhiker  0.0000296907 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1017  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.14 
 
 
398 aa  176  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30 
 
 
449 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30 
 
 
449 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29 
 
 
452 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3117  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.82 
 
 
424 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000975107  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30 
 
 
449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.71 
 
 
467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1670  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.81 
 
 
401 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>