More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_01051 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_01051  exodeoxyribonuclease VII  100 
 
 
382 aa  783    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125237  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02381  exonuclease VII, large subunit  59.16 
 
 
385 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2324  exodeoxyribonuclease VII large subunit  56.68 
 
 
399 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.975786  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1460  exodeoxyribonuclease VII large subunit  55.15 
 
 
386 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0367  exonuclease VII, large subunit  50.4 
 
 
387 aa  418  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01621  exonuclease VII, large subunit  54.26 
 
 
386 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381719  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.52 
 
 
397 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.01 
 
 
393 aa  185  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.01 
 
 
414 aa  182  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.67 
 
 
393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.75 
 
 
414 aa  179  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.72 
 
 
403 aa  176  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.83 
 
 
402 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0368  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.61 
 
 
450 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313066 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.77 
 
 
406 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26430  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.65 
 
 
427 aa  170  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0524422  normal  0.366699 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0430  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.51 
 
 
414 aa  170  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.46 
 
 
402 aa  169  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3117  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.25 
 
 
424 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000975107  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4728  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.97 
 
 
392 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1293  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.31 
 
 
387 aa  167  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.65 
 
 
451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0127  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.05 
 
 
410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40242  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.9 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8482  Exodeoxyribonuclease VII  29.87 
 
 
402 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.52 
 
 
458 aa  162  7e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.52 
 
 
458 aa  162  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3218  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.69 
 
 
457 aa  162  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2514  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.38 
 
 
401 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.54 
 
 
459 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0516461  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1153  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.13 
 
 
542 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0262  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.8 
 
 
427 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.75 
 
 
407 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1221  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.13 
 
 
542 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5539  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.87 
 
 
414 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.55 
 
 
451 aa  159  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0596  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.09 
 
 
448 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000355871  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1093  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.38 
 
 
474 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18484  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0539  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.48 
 
 
459 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1753  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27 
 
 
407 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.198539 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.86 
 
 
460 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144595  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.95 
 
 
398 aa  157  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1017  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.93 
 
 
398 aa  157  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.4 
 
 
448 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.43 
 
 
384 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.73 
 
 
452 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.81 
 
 
475 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.61 
 
 
423 aa  156  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27 
 
 
453 aa  156  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.21 
 
 
408 aa  156  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1557  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.85 
 
 
445 aa  156  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3573  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.44 
 
 
445 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.168579  hitchhiker  0.00774159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1101  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.84 
 
 
432 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.52 
 
 
448 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2462  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.63 
 
 
460 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422545 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1932  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.34 
 
 
460 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2302  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.63 
 
 
445 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.99 
 
 
457 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2544  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.34 
 
 
460 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146847  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1309  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.56 
 
 
398 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1615  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.89 
 
 
445 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000193789  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3195  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.98 
 
 
459 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300243  normal  0.30831 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2568  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.34 
 
 
460 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0973694  normal  0.16842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.52 
 
 
460 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782017  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0743  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.09 
 
 
561 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2946  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.13 
 
 
436 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.877345 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1582  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.89 
 
 
445 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117148  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0752  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.63 
 
 
460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.955357  normal  0.27096 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1675  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.16 
 
 
387 aa  153  4e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2006  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.91 
 
 
444 aa  153  5e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0846  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.92 
 
 
401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1670  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.65 
 
 
401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014352  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.3 
 
 
443 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  32.54 
 
 
452 aa  152  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1926  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.81 
 
 
439 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.81 
 
 
519 aa  152  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.48 
 
 
443 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1006  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.46 
 
 
406 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795132  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.98 
 
 
446 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1915  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.91 
 
 
471 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0029  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.14 
 
 
388 aa  151  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0282686  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.89 
 
 
461 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.2 
 
 
453 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.56 
 
 
447 aa  151  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0056  putative exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.68 
 
 
388 aa  151  2e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.62 
 
 
407 aa  151  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000325061  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.8 
 
 
422 aa  151  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000320124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.97 
 
 
400 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2567  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.51 
 
 
436 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00271156 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.67 
 
 
467 aa  150  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1037  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.46 
 
 
397 aa  150  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0524439  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2550  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.5 
 
 
448 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306428 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3300  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.52 
 
 
519 aa  150  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  27.09 
 
 
450 aa  150  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.67 
 
 
404 aa  150  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1331  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.38 
 
 
462 aa  150  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.701446  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1132  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.45 
 
 
483 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692394  normal  0.0141184 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2644  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.27 
 
 
436 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.603733  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2085  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.05 
 
 
465 aa  149  6e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31500  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.05 
 
 
419 aa  149  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208804  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>