More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1460 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1460  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
386 aa  775    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01621  exonuclease VII, large subunit  97.41 
 
 
386 aa  709    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381719  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02381  exonuclease VII, large subunit  53.83 
 
 
385 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01051  exodeoxyribonuclease VII  54.93 
 
 
382 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125237  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2324  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.41 
 
 
399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.975786  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0367  exonuclease VII, large subunit  48.91 
 
 
387 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.08 
 
 
407 aa  183  6e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.99 
 
 
393 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.04 
 
 
414 aa  180  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.9 
 
 
407 aa  180  4e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.75 
 
 
402 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.04 
 
 
414 aa  179  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1293  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.92 
 
 
387 aa  177  4e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1753  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33 
 
 
407 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.198539 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0029  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.11 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0282686  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.37 
 
 
393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.13 
 
 
406 aa  172  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.22 
 
 
404 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.53 
 
 
398 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2514  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.8 
 
 
401 aa  170  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.02 
 
 
397 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4728  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.53 
 
 
392 aa  169  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.67 
 
 
457 aa  168  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3117  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.22 
 
 
424 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000975107  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1603  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.49 
 
 
410 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.06 
 
 
400 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1017  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.63 
 
 
398 aa  163  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.93 
 
 
403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0368  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.13 
 
 
450 aa  163  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313066 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26 
 
 
458 aa  161  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1675  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.59 
 
 
387 aa  162  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.16 
 
 
422 aa  160  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000320124  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.06 
 
 
451 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0056  putative exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.39 
 
 
388 aa  159  6e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.13 
 
 
449 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1044  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26 
 
 
460 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000021456  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2272  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26 
 
 
460 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00826344  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2149  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26 
 
 
460 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.75 
 
 
446 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28 
 
 
407 aa  158  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000325061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1309  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.17 
 
 
398 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0567  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26 
 
 
510 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0175948  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.58 
 
 
456 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000149221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.58 
 
 
456 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000102008  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.13 
 
 
449 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.23 
 
 
452 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0743  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.77 
 
 
561 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0929  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26 
 
 
460 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.344174  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.13 
 
 
449 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.13 
 
 
449 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0932  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26 
 
 
460 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29303  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.7 
 
 
458 aa  158  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  26.58 
 
 
456 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000142965  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.75 
 
 
446 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26 
 
 
510 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00935981  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2552  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.78 
 
 
432 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.12 
 
 
459 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0516461  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.89 
 
 
398 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0315  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.19 
 
 
406 aa  157  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.68 
 
 
423 aa  157  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.8 
 
 
445 aa  156  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0612657  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1777  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.57 
 
 
428 aa  156  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.41 
 
 
451 aa  156  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.4 
 
 
452 aa  156  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.4 
 
 
452 aa  156  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.4 
 
 
452 aa  156  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.4 
 
 
452 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.4 
 
 
452 aa  156  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.32 
 
 
400 aa  156  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.36 
 
 
411 aa  156  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.35 
 
 
456 aa  156  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.35 
 
 
456 aa  156  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.15 
 
 
454 aa  155  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.13 
 
 
449 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.06 
 
 
452 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.94 
 
 
456 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1557  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.18 
 
 
445 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.06 
 
 
452 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.06 
 
 
452 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2302  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.94 
 
 
445 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  29.49 
 
 
405 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.06 
 
 
452 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0281  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.88 
 
 
417 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.396563  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2644  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.47 
 
 
436 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.603733  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0262  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.1 
 
 
427 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2482  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.66 
 
 
447 aa  153  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.780603  normal  0.458338 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0539  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.03 
 
 
459 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.94 
 
 
453 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.65 
 
 
408 aa  152  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8274  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.78 
 
 
422 aa  152  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3734  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.94 
 
 
456 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000326312  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.82 
 
 
400 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.24 
 
 
455 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0641  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.03 
 
 
449 aa  151  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.782635  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.94 
 
 
460 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782017  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3195  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.03 
 
 
459 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300243  normal  0.30831 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0681  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.33 
 
 
416 aa  150  4e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2550  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.63 
 
 
448 aa  150  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306428 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1932  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.94 
 
 
460 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2544  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.94 
 
 
460 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>