More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_02381 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_02381  exonuclease VII, large subunit  100 
 
 
385 aa  777    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2324  exodeoxyribonuclease VII large subunit  63.38 
 
 
399 aa  492  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.975786  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0367  exonuclease VII, large subunit  60.26 
 
 
387 aa  477  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01051  exodeoxyribonuclease VII  59.16 
 
 
382 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125237  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1460  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.83 
 
 
386 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01621  exonuclease VII, large subunit  54.35 
 
 
386 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381719  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.08 
 
 
393 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.59 
 
 
402 aa  186  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.08 
 
 
397 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.62 
 
 
407 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.52 
 
 
393 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3218  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.47 
 
 
457 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.74 
 
 
398 aa  178  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.66 
 
 
452 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.66 
 
 
452 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.7 
 
 
407 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.08 
 
 
414 aa  175  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.28 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.58 
 
 
414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.36 
 
 
452 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0262  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.32 
 
 
427 aa  169  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2514  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.1 
 
 
401 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0281  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.9 
 
 
417 aa  168  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.396563  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0368  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.64 
 
 
450 aa  167  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313066 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.54 
 
 
451 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1753  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.29 
 
 
407 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.198539 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.09 
 
 
408 aa  166  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.97 
 
 
446 aa  166  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3117  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.38 
 
 
424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000975107  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4728  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.24 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.77 
 
 
451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.55 
 
 
443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.01 
 
 
452 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.01 
 
 
452 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.43 
 
 
452 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.43 
 
 
452 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.43 
 
 
452 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.1 
 
 
422 aa  162  8.000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000320124  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0315  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.32 
 
 
406 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.43 
 
 
452 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0430  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.58 
 
 
414 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1017  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.58 
 
 
398 aa  161  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.25 
 
 
453 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.25 
 
 
400 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.43 
 
 
452 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.86 
 
 
443 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0681  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.93 
 
 
416 aa  160  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1293  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.54 
 
 
387 aa  160  3e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.23 
 
 
423 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.13 
 
 
402 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1153  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.55 
 
 
542 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1093  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.69 
 
 
474 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18484  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1221  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.55 
 
 
542 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.94 
 
 
448 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8482  Exodeoxyribonuclease VII  31.06 
 
 
402 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0539  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.07 
 
 
459 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0029  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.23 
 
 
388 aa  158  1e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0282686  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0641  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.3 
 
 
449 aa  158  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.782635  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.09 
 
 
475 aa  158  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.73 
 
 
400 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2302  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.73 
 
 
445 aa  159  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1309  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.77 
 
 
398 aa  159  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1675  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.49 
 
 
387 aa  157  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1557  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.37 
 
 
445 aa  158  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.72 
 
 
458 aa  158  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.14 
 
 
458 aa  158  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3195  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.71 
 
 
459 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300243  normal  0.30831 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.57 
 
 
447 aa  155  9e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.69 
 
 
459 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0516461  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0743  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.3 
 
 
561 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0878  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.88 
 
 
417 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.56 
 
 
444 aa  155  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1089  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.75 
 
 
403 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0708461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8274  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.59 
 
 
422 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0857  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.96 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.08 
 
 
448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.79 
 
 
384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2272  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.3 
 
 
460 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00826344  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2149  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.3 
 
 
460 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0929  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.3 
 
 
460 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.344174  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1044  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.3 
 
 
460 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000021456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0932  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.3 
 
 
460 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29303  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.93 
 
 
510 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00935981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0567  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.93 
 
 
510 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0175948  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26430  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.58 
 
 
427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0524422  normal  0.366699 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.65 
 
 
519 aa  153  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.96 
 
 
457 aa  152  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0127  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.29 
 
 
410 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40242  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.26 
 
 
400 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1615  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.08 
 
 
445 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000193789  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1582  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.08 
 
 
445 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117148  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0056  putative exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.18 
 
 
388 aa  151  2e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1732  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.17 
 
 
480 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.709367  hitchhiker  0.00631476 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.02 
 
 
460 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144595  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1777  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.33 
 
 
428 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.62 
 
 
411 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5539  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.53 
 
 
414 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1603  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.05 
 
 
410 aa  150  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.51 
 
 
454 aa  150  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.15 
 
 
407 aa  150  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000325061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>