More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0367 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0367  exonuclease VII, large subunit  100 
 
 
387 aa  770    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2324  exodeoxyribonuclease VII large subunit  69.51 
 
 
399 aa  547  1e-154  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.975786  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02381  exonuclease VII, large subunit  60.26 
 
 
385 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01051  exodeoxyribonuclease VII  50.4 
 
 
382 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125237  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1460  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.91 
 
 
386 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01621  exonuclease VII, large subunit  48.64 
 
 
386 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381719  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.74 
 
 
414 aa  189  7e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.74 
 
 
414 aa  189  8e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.66 
 
 
407 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.82 
 
 
397 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.83 
 
 
406 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.93 
 
 
407 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.52 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.08 
 
 
393 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1675  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.22 
 
 
387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2514  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.42 
 
 
401 aa  180  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3117  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.17 
 
 
424 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000975107  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.82 
 
 
404 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.33 
 
 
408 aa  176  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.04 
 
 
458 aa  175  9e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.72 
 
 
446 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.87 
 
 
451 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.44 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1293  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.12 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.87 
 
 
453 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.08 
 
 
448 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.65 
 
 
452 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.65 
 
 
452 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.65 
 
 
452 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.3 
 
 
398 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0262  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.08 
 
 
427 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.65 
 
 
452 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.65 
 
 
452 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2302  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.79 
 
 
445 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4728  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.33 
 
 
392 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.86 
 
 
452 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.86 
 
 
452 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.41 
 
 
452 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.41 
 
 
452 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1557  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.79 
 
 
445 aa  170  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0315  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.47 
 
 
406 aa  169  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.29 
 
 
445 aa  168  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0612657  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2567  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.55 
 
 
436 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00271156 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.43 
 
 
458 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1926  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.58 
 
 
439 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.65 
 
 
400 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5539  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.24 
 
 
414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.89 
 
 
398 aa  166  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.42 
 
 
452 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.05 
 
 
403 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0281  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.55 
 
 
417 aa  166  5e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.396563  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0539  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.5 
 
 
459 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1226  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.42 
 
 
528 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.901078  normal  0.0774047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2552  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.24 
 
 
432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277248 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1753  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.16 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.198539 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.31 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.182071  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1017  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.15 
 
 
398 aa  164  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8482  Exodeoxyribonuclease VII  33.33 
 
 
402 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  32.92 
 
 
452 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2644  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.45 
 
 
436 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.603733  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0605  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.7 
 
 
516 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0029  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.51 
 
 
388 aa  162  8.000000000000001e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0282686  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1309  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.32 
 
 
398 aa  162  9e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.73 
 
 
405 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0681  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.53 
 
 
416 aa  161  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0368  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.77 
 
 
450 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313066 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1093  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.26 
 
 
474 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18484  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1089  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.16 
 
 
403 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0708461  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.75 
 
 
407 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000325061  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1153  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.64 
 
 
542 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1221  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.64 
 
 
542 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.28 
 
 
459 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0516461  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.46 
 
 
402 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.78 
 
 
406 aa  159  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3218  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.24 
 
 
457 aa  159  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1777  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.76 
 
 
428 aa  159  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.04 
 
 
447 aa  159  9e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1037  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.2 
 
 
397 aa  159  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0524439  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4890  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.31 
 
 
444 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.17 
 
 
460 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782017  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.14 
 
 
460 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144595  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0596  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.8 
 
 
448 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000355871  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2037  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.22 
 
 
465 aa  157  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0878  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.27 
 
 
417 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1582  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.17 
 
 
445 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117148  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1615  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.17 
 
 
445 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000193789  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.93 
 
 
448 aa  157  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0888  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.68 
 
 
443 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2568  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.83 
 
 
460 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0973694  normal  0.16842 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1932  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.83 
 
 
460 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2544  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.83 
 
 
460 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146847  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2413  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.17 
 
 
402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0752  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.52 
 
 
460 aa  156  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.955357  normal  0.27096 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.17 
 
 
423 aa  155  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.49 
 
 
469 aa  155  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.58 
 
 
448 aa  155  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1132  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.46 
 
 
483 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692394  normal  0.0141184 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1915  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.02 
 
 
471 aa  155  9e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3195  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.54 
 
 
459 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300243  normal  0.30831 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0743  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.4 
 
 
561 aa  155  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>