More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7199 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7199  Exodeoxyribonuclease VII  100 
 
 
475 aa  981    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2199  Exodeoxyribonuclease VII  46.88 
 
 
464 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.503662  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3775  exodeoxyribonuclease VII  44.94 
 
 
478 aa  426  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0501  Exodeoxyribonuclease VII  33.55 
 
 
404 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3317  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.17 
 
 
387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1128  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.28 
 
 
460 aa  223  4.9999999999999996e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0236  Exodeoxyribonuclease VII  31.27 
 
 
526 aa  170  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1369  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.78 
 
 
508 aa  167  5e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0465393 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1091  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.87 
 
 
514 aa  159  8e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0178  exodeoxyribonuclease VII  26.75 
 
 
526 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106589  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1291  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.07 
 
 
516 aa  156  9e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00804407  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1209  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.29 
 
 
522 aa  151  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000650219  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1869  exodeoxyribonuclease VII  25.46 
 
 
530 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.205151  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0198  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.95 
 
 
555 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4878  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.93 
 
 
576 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.983312 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0148  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.39 
 
 
413 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214735  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.63 
 
 
463 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.83 
 
 
458 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.26 
 
 
446 aa  117  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.49 
 
 
463 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.28 
 
 
463 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1221  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.95 
 
 
542 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1008  exonuclease VII large subunit  28.48 
 
 
467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596723  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1233  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.99 
 
 
448 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.95 
 
 
443 aa  113  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.38 
 
 
458 aa  113  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.58 
 
 
443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.22 
 
 
476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.53 
 
 
448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3211  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.77 
 
 
450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173866  normal  0.203327 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1304  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.73 
 
 
448 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566056  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1153  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.53 
 
 
542 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1761  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.25 
 
 
455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3009  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.79 
 
 
472 aa  110  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.92 
 
 
465 aa  110  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1916  exodeoxyribonuclease VII  27.35 
 
 
478 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0537886  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.75 
 
 
511 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286827 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1093  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.27 
 
 
474 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1378  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.43 
 
 
448 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6807  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.11 
 
 
501 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0976698  normal  0.286525 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2647  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.27 
 
 
466 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  25.67 
 
 
452 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.77 
 
 
452 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.84 
 
 
461 aa  108  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.95 
 
 
445 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.48 
 
 
456 aa  107  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.23 
 
 
448 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.96 
 
 
445 aa  107  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.38 
 
 
448 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.19 
 
 
448 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.88 
 
 
451 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.92 
 
 
445 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.38 
 
 
459 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1979  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.23 
 
 
414 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.81 
 
 
452 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.81 
 
 
452 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.81 
 
 
452 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.81 
 
 
452 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.44 
 
 
462 aa  104  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.81 
 
 
452 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.24 
 
 
451 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2644  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.14 
 
 
436 aa  103  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.603733  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0641  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.49 
 
 
449 aa  102  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.782635  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1569  exodeoxyribonuclease VII  26.9 
 
 
495 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.1924  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1915  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.8 
 
 
471 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.3 
 
 
414 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.22 
 
 
463 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25 
 
 
463 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.6 
 
 
452 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.34 
 
 
452 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1132  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  22.55 
 
 
483 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692394  normal  0.0141184 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.32 
 
 
393 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.39 
 
 
452 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.6 
 
 
452 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.44 
 
 
464 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.6 
 
 
453 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.09 
 
 
414 aa  101  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4244  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.14 
 
 
444 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3125  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.98 
 
 
442 aa  99.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284972  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.58 
 
 
446 aa  99.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000016399  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4728  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.73 
 
 
392 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2951  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.1 
 
 
447 aa  98.6  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19698  normal  0.152138 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.61 
 
 
469 aa  97.8  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1136  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.46 
 
 
450 aa  97.8  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000110023  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2759  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.33 
 
 
443 aa  97.8  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.340088  normal  0.610939 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0529  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.27 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3573  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.22 
 
 
445 aa  97.1  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.168579  hitchhiker  0.00774159 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.17 
 
 
449 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1926  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.71 
 
 
439 aa  97.1  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.54 
 
 
445 aa  96.7  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0612657  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.28 
 
 
449 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.27 
 
 
454 aa  96.3  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.28 
 
 
449 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.28 
 
 
449 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1615  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.37 
 
 
445 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000193789  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.34 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.79 
 
 
397 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.84 
 
 
398 aa  95.1  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1582  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.37 
 
 
445 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117148  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4389  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.03 
 
 
432 aa  95.9  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>