More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0347 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0370  exodeoxyribonuclease VII large subunit  99.74 
 
 
387 aa  786    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.284967  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0347  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
387 aa  787    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1634  exodeoxyribonuclease VII large subunit  95.35 
 
 
387 aa  757    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.718824  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1351  exodeoxyribonuclease VII large subunit  61.08 
 
 
387 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1675  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.8 
 
 
387 aa  348  1e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1293  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.33 
 
 
387 aa  311  1e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.85 
 
 
387 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.182071  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.05 
 
 
454 aa  262  8e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.48 
 
 
461 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.6 
 
 
464 aa  259  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.53 
 
 
462 aa  256  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0281  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.24 
 
 
417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.396563  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.03 
 
 
407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.41 
 
 
458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000130865  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0681  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.73 
 
 
416 aa  253  3e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.29 
 
 
451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.96 
 
 
465 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1216  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48 
 
 
448 aa  252  7e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0401789  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.76 
 
 
467 aa  251  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.68 
 
 
443 aa  250  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  43.79 
 
 
450 aa  250  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.16 
 
 
407 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.55 
 
 
456 aa  249  8e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000149221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.55 
 
 
456 aa  249  8e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000102008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  42.55 
 
 
456 aa  249  8e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000142965  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.2 
 
 
456 aa  247  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.2 
 
 
456 aa  246  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.2 
 
 
456 aa  246  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.2 
 
 
455 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.32 
 
 
443 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.22 
 
 
453 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3734  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.2 
 
 
456 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000326312  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.2 
 
 
449 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.2 
 
 
449 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.2 
 
 
449 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.57 
 
 
457 aa  245  8e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.11 
 
 
414 aa  244  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.65 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.18 
 
 
408 aa  245  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.41 
 
 
414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.84 
 
 
449 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.84 
 
 
449 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.94 
 
 
451 aa  242  9e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.71 
 
 
458 aa  241  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.65 
 
 
452 aa  239  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.65 
 
 
452 aa  240  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.35 
 
 
452 aa  239  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.35 
 
 
452 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.35 
 
 
452 aa  239  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.35 
 
 
452 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.35 
 
 
452 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.35 
 
 
452 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.35 
 
 
452 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.02 
 
 
444 aa  239  6.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.23 
 
 
446 aa  239  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1753  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.03 
 
 
407 aa  239  8e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.198539 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.2 
 
 
400 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.2 
 
 
400 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2951  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.94 
 
 
447 aa  237  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19698  normal  0.152138 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.96 
 
 
446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.72 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.05 
 
 
475 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1136  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.62 
 
 
450 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000110023  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0315  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.96 
 
 
406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1193  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.45 
 
 
458 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.10806e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.7 
 
 
446 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000016399  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1301  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.45 
 
 
459 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000114365  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0410  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.45 
 
 
459 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000134785  hitchhiker  0.000369784 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1296  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.45 
 
 
442 aa  231  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430502  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.7 
 
 
448 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1304  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.09 
 
 
448 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566056  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2360  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.01 
 
 
447 aa  229  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.203365  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2647  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.21 
 
 
466 aa  229  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1378  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.28 
 
 
448 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.28 
 
 
448 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3125  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.81 
 
 
442 aa  229  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284972  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.28 
 
 
448 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.28 
 
 
448 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.43 
 
 
445 aa  229  8e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.19 
 
 
458 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.15 
 
 
445 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1233  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.97 
 
 
448 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.25 
 
 
405 aa  226  7e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1603  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.6 
 
 
410 aa  225  8e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.64 
 
 
447 aa  225  9e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1558  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.45 
 
 
442 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0686099  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.44 
 
 
402 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.86 
 
 
396 aa  224  2e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1890  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.13 
 
 
446 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101941  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.15 
 
 
445 aa  223  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.83026  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1017  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.23 
 
 
398 aa  223  6e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.28 
 
 
445 aa  222  7e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3121  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.18 
 
 
444 aa  222  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.84 
 
 
458 aa  222  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.81 
 
 
453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1615  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.6 
 
 
445 aa  220  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000193789  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2946  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.29 
 
 
436 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.877345 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1582  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.6 
 
 
445 aa  220  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.07 
 
 
463 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.84 
 
 
458 aa  219  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>