More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1351 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1351  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
387 aa  779    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0370  exodeoxyribonuclease VII large subunit  61.08 
 
 
387 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.284967  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0347  exodeoxyribonuclease VII large subunit  61.08 
 
 
387 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1634  exodeoxyribonuclease VII large subunit  60.57 
 
 
387 aa  436  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.718824  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1675  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.94 
 
 
387 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1293  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.43 
 
 
387 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.57 
 
 
387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.182071  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.7 
 
 
454 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.52 
 
 
451 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0281  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.23 
 
 
417 aa  258  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.396563  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.3 
 
 
461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  39.03 
 
 
450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.67 
 
 
467 aa  254  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.12 
 
 
407 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.39 
 
 
407 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39 
 
 
452 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.71 
 
 
451 aa  250  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.69 
 
 
448 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.1 
 
 
453 aa  248  9e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.71 
 
 
452 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.71 
 
 
452 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.71 
 
 
452 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.21 
 
 
462 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.71 
 
 
452 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.71 
 
 
452 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.71 
 
 
452 aa  247  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.71 
 
 
452 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.71 
 
 
452 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.71 
 
 
452 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0681  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.59 
 
 
416 aa  246  6e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.31 
 
 
458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.23 
 
 
464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.92 
 
 
414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.24 
 
 
414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.28 
 
 
458 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000130865  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.43 
 
 
411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.46 
 
 
446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.64 
 
 
456 aa  243  5e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000149221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.64 
 
 
456 aa  243  5e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000102008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  43.64 
 
 
456 aa  243  5e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000142965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.27 
 
 
455 aa  242  9e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3734  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.27 
 
 
456 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000326312  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0315  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.7 
 
 
406 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.27 
 
 
465 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.27 
 
 
456 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.27 
 
 
456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.14 
 
 
405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.27 
 
 
456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.8 
 
 
446 aa  240  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.18 
 
 
458 aa  240  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1753  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.46 
 
 
407 aa  240  4e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.198539 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.06 
 
 
402 aa  239  5e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45 
 
 
449 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45 
 
 
449 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45 
 
 
449 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45 
 
 
449 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.94 
 
 
408 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45 
 
 
449 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2951  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  47.33 
 
 
447 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19698  normal  0.152138 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.37 
 
 
396 aa  238  2e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.58 
 
 
447 aa  237  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.22 
 
 
444 aa  237  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.82 
 
 
457 aa  237  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1932  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.14 
 
 
460 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2544  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.14 
 
 
460 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146847  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2568  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.14 
 
 
460 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0973694  normal  0.16842 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.83 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.9 
 
 
448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.68 
 
 
463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.68 
 
 
463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.88 
 
 
460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782017  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36 
 
 
476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.2 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1304  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.46 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566056  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2462  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.19 
 
 
460 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422545 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0752  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.88 
 
 
460 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.955357  normal  0.27096 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2398  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.82 
 
 
467 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.64 
 
 
448 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1378  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.64 
 
 
448 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2804  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.22 
 
 
469 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345975  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.64 
 
 
448 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.18 
 
 
448 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.19 
 
 
460 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144595  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.59 
 
 
443 aa  232  9e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2647  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.46 
 
 
466 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1890  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.86 
 
 
446 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.58 
 
 
393 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.53 
 
 
423 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0538  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.54 
 
 
481 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839459  unclonable  0.0000000860109 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1136  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.77 
 
 
450 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000110023  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.49 
 
 
403 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1603  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.42 
 
 
410 aa  231  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.04 
 
 
445 aa  230  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.81 
 
 
463 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1233  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.21 
 
 
448 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.97 
 
 
459 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1216  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.66 
 
 
448 aa  229  5e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0401789  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.78 
 
 
446 aa  229  8e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000016399  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.68 
 
 
463 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.86 
 
 
445 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>