More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36090 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 295 aa  581  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  77.51 
 
 		 272 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0974  ABC transporter related protein  78.95 
 
 		 279 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  74.19 
 
 		 276 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2592  ABC transporter related  70.45 
 
 		 268 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0099821  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  69.39 
 
 		 274 aa  339  2.9999999999999998e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.905308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2751  ABC transporter related  69.64 
 
 		 249 aa  333  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  61.63 
 
 		 306 aa  315  6e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  64.78 
 
 		 254 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.8 
 
 		 256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  59.11 
 
 		 301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  63.97 
 
 		 254 aa  308  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3072  ABC transporter related protein  62.25 
 
 		 254 aa  299  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0146986  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.29 
 
 		 293 aa  297  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21626  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  58.23 
 
 		 261 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  59.6 
 
 		 252 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  59.09 
 
 		 259 aa  281  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2589  ATP-binding transport protein NatA  58.7 
 
 		 266 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.408024  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  57.03 
 
 		 257 aa  265  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3107  ABC transporter related  56.54 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000121464  hitchhiker  0.00525293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  46.34 
 
 		 253 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  48.18 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  46.96 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.91 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  37.66 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  35.19 
 
 		 327 aa  175  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  39.92 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  34.58 
 
 		 241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  35.37 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  34.58 
 
 		 241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 		 241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 		 241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 		 241 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  41.45 
 
 		 250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  34.17 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  34.17 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  35.95 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  41.15 
 
 		 248 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  34.32 
 
 		 414 aa  169  4e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  33.75 
 
 		 244 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  38.01 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  40.69 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  33.75 
 
 		 241 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  32.26 
 
 		 250 aa  169  6e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  40.25 
 
 		 244 aa  169  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  33.75 
 
 		 241 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.64 
 
 		 312 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  39.83 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  38.18 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  31.25 
 
 		 253 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  35.63 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  35.44 
 
 		 242 aa  166  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.17 
 
 		 380 aa  166  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0867076  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  41.98 
 
 		 248 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  41.56 
 
 		 248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  38.71 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1130  ABC transporter related  38.62 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  hitchhiker  0.000478037 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  39.21 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  38.14 
 
 		 244 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  31.67 
 
 		 241 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  41.82 
 
 		 305 aa  162  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  31.8 
 
 		 237 aa  161  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  38.99 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  32.24 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.38 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  40.16 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  37.95 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  36.99 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  35.22 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  40.91 
 
 		 314 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  33.47 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.67 
 
 		 345 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2857  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 247 aa  159  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00741343  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  33.05 
 
 		 274 aa  159  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 		 266 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  30.83 
 
 		 241 aa  158  8e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  39.29 
 
 		 310 aa  158  9e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  37.71 
 
 		 244 aa  158  9e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  38.22 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  37.18 
 
 		 247 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  37.76 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  40.62 
 
 		 337 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  34.18 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  33.19 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  37.67 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  39.39 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  34.21 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  38.14 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  38.14 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  34.05 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  39.37 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  38.14 
 
 		 244 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  33.49 
 
 		 319 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  36.07 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  38.29 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  38.14 
 
 		 244 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  38.14 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  35.32 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>