45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35490 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  100 
 
 		 212 aa  410  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  43.9 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  52.63 
 
 		 107 aa  86.3  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  85.5  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  51.28 
 
 		 109 aa  85.1  7e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  39.06 
 
 		 253 aa  84.7  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  55.26 
 
 		 133 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  51.32 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  49.32 
 
 		 336 aa  81.6  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  42.71 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  51.32 
 
 		 265 aa  72  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  48.61 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  35.4 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  44.32 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  38.89 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  40.45 
 
 		 137 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0052  hypothetical protein  44.68 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000726443  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  42.22 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  34.96 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  42.47 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  46.58 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0226  TM2  37.11 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  36.59 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  35.48 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  40.98 
 
 		 92 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1506  TM2 domain containing protein  54.76 
 
 		 87 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 155 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  51.16 
 
 		 88 aa  51.2  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  40.79 
 
 		 111 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  33.82 
 
 		 116 aa  49.3  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  38.71 
 
 		 154 aa  49.3  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  42.86 
 
 		 344 aa  48.1  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  45.76 
 
 		 111 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  37.21 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  43.75 
 
 		 117 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2820  TM2 domain-containing protein  40.35 
 
 		 143 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  35.06 
 
 		 128 aa  46.2  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11631  hypothetical protein  40 
 
 		 146 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0708972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1547  hypothetical protein  34.85 
 
 		 91 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0248034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  36.71 
 
 		 166 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  47.37 
 
 		 79 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3876  TM2 domain containing protein  41.27 
 
 		 78 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  38.67 
 
 		 133 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1814  hypothetical protein  31.33 
 
 		 91 aa  42.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1421  TM2 domain containing protein  42.47 
 
 		 149 aa  42  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>