117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33080 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_33080  predicted Zn-dependent peptidase  100 
 
 
449 aa  841    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.519293  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06880  predicted Zn-dependent peptidase  31.07 
 
 
462 aa  107  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408528  normal  0.0872557 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3795  peptidase M16-like  27.7 
 
 
448 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.417189  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4237  peptidase M16 domain protein  28.6 
 
 
451 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0932  peptidase M16 domain-containing protein  26.9 
 
 
455 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0864  peptidase M16 domain protein  31.38 
 
 
462 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1776  peptidase M16 domain-containing protein  27.09 
 
 
438 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3746  peptidase M16 domain-containing protein  30.63 
 
 
447 aa  73.2  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1583  peptidase M16 domain protein  26.17 
 
 
453 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115865  normal  0.227723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4127  peptidase M16 domain-containing protein  30.49 
 
 
447 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  27.8 
 
 
945 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  22.92 
 
 
479 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  29.7 
 
 
496 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  26.36 
 
 
486 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1419  processing peptidase  21.79 
 
 
424 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  22.76 
 
 
495 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  28.63 
 
 
949 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  27.51 
 
 
949 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  21.86 
 
 
495 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  28.69 
 
 
497 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  24.38 
 
 
496 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  35.33 
 
 
519 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1347  peptidase M16 domain protein  23.44 
 
 
426 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1226  processing protease  28.47 
 
 
421 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.203575 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  28.22 
 
 
949 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  35.33 
 
 
520 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  26.76 
 
 
494 aa  57.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  22.34 
 
 
958 aa  57.4  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  29.46 
 
 
944 aa  57  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  35.33 
 
 
520 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3616  peptidase M16 domain protein  28.08 
 
 
425 aa  57  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  21.36 
 
 
478 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  24.93 
 
 
434 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  26.92 
 
 
944 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  24.12 
 
 
477 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  24.08 
 
 
462 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3239  zinc protease  23.6 
 
 
427 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00842119  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  25.07 
 
 
494 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1590  peptidase M16 domain protein  18.77 
 
 
424 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.508475  normal  0.157035 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  23.77 
 
 
945 aa  54.7  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3238  peptidase M16 domain-containing protein  28 
 
 
431 aa  54.3  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  19.73 
 
 
423 aa  53.9  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0365  processing peptidase  22.46 
 
 
424 aa  53.9  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  25.62 
 
 
944 aa  53.5  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  24.11 
 
 
496 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  27.63 
 
 
949 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  26.45 
 
 
471 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  26.65 
 
 
495 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4248  peptidase M16 domain protein  22.66 
 
 
426 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  23.53 
 
 
959 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  23.21 
 
 
969 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  22.25 
 
 
422 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  21.45 
 
 
945 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  21.86 
 
 
479 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  22.28 
 
 
462 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0496  processing peptidase  28.04 
 
 
903 aa  49.7  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000425054  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  29.17 
 
 
457 aa  49.7  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  21.25 
 
 
476 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  25.55 
 
 
495 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02700  putative metallopeptidase, M16 family protein  21.71 
 
 
687 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  22.22 
 
 
767 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  27.84 
 
 
465 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  28.07 
 
 
945 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  25.79 
 
 
950 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3568  peptidase M16 domain-containing protein  28.57 
 
 
448 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.742239  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  27.84 
 
 
465 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  25.79 
 
 
950 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  22.45 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1312  peptidase M16 domain protein  22.98 
 
 
840 aa  49.3  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  25.79 
 
 
944 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3360  M16 family peptidase  29.41 
 
 
439 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  25.64 
 
 
464 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  27.16 
 
 
439 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  24.32 
 
 
454 aa  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  23.84 
 
 
496 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5951  peptidase M16 domain protein  22.7 
 
 
426 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  23.33 
 
 
419 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  27.91 
 
 
451 aa  47.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  22.42 
 
 
471 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0560  peptidase M16 domain protein  27.56 
 
 
428 aa  47.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  27.52 
 
 
444 aa  47.8  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4236  processing peptidase  21.56 
 
 
421 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385925 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  27.6 
 
 
418 aa  47.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  25.33 
 
 
943 aa  47.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  25.34 
 
 
950 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4197  peptidase M16 domain protein  21.56 
 
 
421 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0396  peptidase, M16 family  27.56 
 
 
424 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0705  peptidase M16 domain protein  22.36 
 
 
427 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  27.49 
 
 
439 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0966  peptidase M16-like  20.57 
 
 
413 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3947  peptidase M16 domain-containing protein  29.02 
 
 
448 aa  47  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530134  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  25.14 
 
 
436 aa  46.6  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  22.73 
 
 
495 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  24.07 
 
 
952 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0082  peptidase M16 domain-containing protein  26.14 
 
 
477 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281002 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  25 
 
 
424 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  27.69 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  21.88 
 
 
429 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  20.36 
 
 
474 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  21.09 
 
 
460 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>