110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01370 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01370  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  950    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  83.55 
 
 		 482 aa  723    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0132  band 7 protein  73.71 
 
 		 491 aa  568  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2091  band 7 protein  35.95 
 
 		 516 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648722 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5091  band 7 protein  36.77 
 
 		 459 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000550559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2104  band 7 protein  38.56 
 
 		 513 aa  208  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1912  band 7 protein  35.76 
 
 		 492 aa  205  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0712  band 7 protein  35.6 
 
 		 496 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.350479 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3314  band 7 protein  31.55 
 
 		 495 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  31.35 
 
 		 475 aa  176  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  32.31 
 
 		 507 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0367  hypothetical protein  34.38 
 
 		 499 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  32.39 
 
 		 537 aa  168  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8817  band 7 protein  32.38 
 
 		 518 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.209913  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0812  band 7 protein  29.18 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  31.67 
 
 		 507 aa  156  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  30.12 
 
 		 509 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.22 
 
 		 526 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.22 
 
 		 526 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  29.01 
 
 		 524 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  29.42 
 
 		 524 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.01 
 
 		 524 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  29.01 
 
 		 524 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  29.01 
 
 		 524 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  29.22 
 
 		 524 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  29.01 
 
 		 524 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  29.01 
 
 		 526 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  29.55 
 
 		 519 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1402  flotillin  26.28 
 
 		 489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0725365  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1073  band 7 protein  31.17 
 
 		 477 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.532983  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05180  hypothetical protein  31.49 
 
 		 499 aa  133  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  33.41 
 
 		 477 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0503  band 7 protein  34.77 
 
 		 370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00953758  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1761  band 7 protein  31.32 
 
 		 480 aa  126  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000813907 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2287  band 7 protein  33.33 
 
 		 467 aa  120  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8346  band 7 protein  33.21 
 
 		 383 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0314  band 7 protein  32.14 
 
 		 460 aa  114  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  27.17 
 
 		 519 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0445  band 7 protein  29.66 
 
 		 538 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116716  normal  0.17273 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0782  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  27.7 
 
 		 503 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28446  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  30.27 
 
 		 500 aa  101  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0402  band 7 protein  29.06 
 
 		 473 aa  100  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  28.65 
 
 		 504 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  27.09 
 
 		 507 aa  97.4  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2499  Band 7 protein  30.52 
 
 		 446 aa  97.1  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0504738  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2920  band 7 protein  27.81 
 
 		 450 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3176  band 7 protein  27.81 
 
 		 450 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.689378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0403  band 7 protein  30.14 
 
 		 430 aa  93.6  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0313  band 7 protein  26.1 
 
 		 423 aa  93.6  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1727  band 7 protein  27.21 
 
 		 472 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000752152  normal  0.0958573 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0945  band 7 protein  25.76 
 
 		 451 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1397  Band 7 protein  32.24 
 
 		 447 aa  87  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.936063 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2921  band 7 protein  25.27 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3175  band 7 protein  26.74 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1144  band 7 protein  27.56 
 
 		 473 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.401105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1398  Band 7 protein  26.27 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0946  band 7 protein  26.62 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1186  band 7 protein  24.14 
 
 		 590 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2816  band 7 protein  25.21 
 
 		 592 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2899  band 7 protein  25.21 
 
 		 592 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2996  band 7 protein  24.6 
 
 		 592 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.37 
 
 		 553 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1267  band 7 protein  23.94 
 
 		 592 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353879 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  23.17 
 
 		 553 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  23.94 
 
 		 592 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3109  band 7 protein  23.94 
 
 		 592 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3252  band 7 protein  23.94 
 
 		 592 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2218  hypothetical protein  24.94 
 
 		 558 aa  68.2  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2498  Band 7 protein  28.03 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.115439  hitchhiker  0.00327007 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  23.2 
 
 		 553 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  23.17 
 
 		 553 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  23.17 
 
 		 553 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  23.17 
 
 		 549 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.98 
 
 		 553 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1377  hypothetical protein  24.79 
 
 		 592 aa  66.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1084  band 7 protein  22.79 
 
 		 604 aa  66.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  22.98 
 
 		 542 aa  66.6  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0804  hypothetical protein  25 
 
 		 585 aa  65.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0005  band 7 protein  25.64 
 
 		 569 aa  65.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0238234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3622  band 7 protein  23.36 
 
 		 587 aa  63.5  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1794  band 7 protein  23.47 
 
 		 560 aa  63.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511769  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01973  band 7 protein  22.68 
 
 		 589 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0247971  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  24.02 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3388  inner membrane protein YqiK  22.87 
 
 		 559 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  22.37 
 
 		 559 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3554  inner membrane protein YqiK  22.47 
 
 		 559 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  22.37 
 
 		 559 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  22.77 
 
 		 559 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0946  band 7 protein  22.83 
 
 		 595 aa  54.7  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1616  SPFH domain-containing protein  24.75 
 
 		 477 aa  53.5  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06177  flotillin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G08180)  22.74 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.226938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4814  hypothetical protein  24.84 
 
 		 964 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  29.77 
 
 		 326 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  31.07 
 
 		 332 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3022  band 7 protein  21.56 
 
 		 570 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  30.43 
 
 		 336 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  30.43 
 
 		 336 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.43 
 
 		 334 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  29.35 
 
 		 331 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  25.19 
 
 		 311 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>