131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2255 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  100 
 
 		 507 aa  1018    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  90.41 
 
 		 504 aa  861    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1144  band 7 protein  56.07 
 
 		 473 aa  511  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.401105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  47.45 
 
 		 519 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  42.75 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3314  band 7 protein  29.58 
 
 		 495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018778  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  29.03 
 
 		 507 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  29.98 
 
 		 475 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  28.81 
 
 		 507 aa  154  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0445  band 7 protein  27.09 
 
 		 538 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116716  normal  0.17273 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  27.91 
 
 		 524 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  27.91 
 
 		 524 aa  140  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.71 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  27.71 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  27.71 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  27.71 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.71 
 
 		 526 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.71 
 
 		 526 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  25.52 
 
 		 477 aa  139  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  27.71 
 
 		 519 aa  139  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  27.71 
 
 		 524 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  27.71 
 
 		 526 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1402  flotillin  26.55 
 
 		 489 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0725365  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  29.94 
 
 		 537 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0313  band 7 protein  27.59 
 
 		 423 aa  123  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  26.51 
 
 		 509 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0403  band 7 protein  28.25 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1398  Band 7 protein  26.84 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0945  band 7 protein  24.95 
 
 		 451 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2287  band 7 protein  27.73 
 
 		 467 aa  113  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338349  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0314  band 7 protein  24.46 
 
 		 460 aa  113  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1727  band 7 protein  25.18 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000752152  normal  0.0958573 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0782  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  31.4 
 
 		 503 aa  111  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28446  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2499  Band 7 protein  26.52 
 
 		 446 aa  110  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0504738  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  26.49 
 
 		 482 aa  108  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2498  Band 7 protein  31.07 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.115439  hitchhiker  0.00327007 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  25.5 
 
 		 542 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0812  band 7 protein  25.64 
 
 		 468 aa  104  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0402  band 7 protein  28.51 
 
 		 473 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.14 
 
 		 553 aa  104  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2921  band 7 protein  25 
 
 		 421 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3175  band 7 protein  25 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  24.91 
 
 		 553 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0946  band 7 protein  25.23 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  24.91 
 
 		 553 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  24.91 
 
 		 553 aa  100  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  24.91 
 
 		 549 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  24.91 
 
 		 553 aa  100  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1397  Band 7 protein  25.11 
 
 		 447 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.936063 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06177  flotillin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G08180)  26.18 
 
 		 423 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.226938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3176  band 7 protein  22.64 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.689378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2920  band 7 protein  22.64 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25 
 
 		 553 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01370  hypothetical protein  26.18 
 
 		 490 aa  94.4  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1084  band 7 protein  26.57 
 
 		 604 aa  91.3  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1794  band 7 protein  25 
 
 		 560 aa  90.9  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511769  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  25.33 
 
 		 592 aa  90.9  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3109  band 7 protein  25.33 
 
 		 592 aa  90.9  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3252  band 7 protein  25.33 
 
 		 592 aa  90.9  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1267  band 7 protein  25.33 
 
 		 592 aa  90.9  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353879 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2104  band 7 protein  30 
 
 		 513 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5091  band 7 protein  25.78 
 
 		 459 aa  89  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000550559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  26 
 
 		 559 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3554  inner membrane protein YqiK  25.81 
 
 		 559 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  25.81 
 
 		 559 aa  87  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1413  band 7 protein  26.01 
 
 		 744 aa  87  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  25.81 
 
 		 559 aa  87  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3388  inner membrane protein YqiK  24.86 
 
 		 559 aa  86.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1377  hypothetical protein  29.44 
 
 		 592 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2996  band 7 protein  25.39 
 
 		 592 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2816  band 7 protein  29.12 
 
 		 592 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0804  hypothetical protein  28.3 
 
 		 585 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01973  band 7 protein  24.95 
 
 		 589 aa  85.9  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0247971  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  27.06 
 
 		 562 aa  84.7  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2899  band 7 protein  28.5 
 
 		 592 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1186  band 7 protein  24.86 
 
 		 590 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3622  band 7 protein  29.25 
 
 		 587 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1912  band 7 protein  30.22 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1761  band 7 protein  27.91 
 
 		 480 aa  80.1  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000813907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8346  band 7 protein  30.67 
 
 		 383 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4673  band 7 protein  25.84 
 
 		 560 aa  79  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.122447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0946  band 7 protein  27.78 
 
 		 595 aa  79  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1073  band 7 protein  27.8 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.532983  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0132  band 7 protein  29.32 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0005  band 7 protein  25.55 
 
 		 569 aa  77.8  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0238234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0712  band 7 protein  27.84 
 
 		 496 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.350479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8817  band 7 protein  25.12 
 
 		 518 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.209913  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3022  band 7 protein  29.14 
 
 		 570 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05180  hypothetical protein  31.11 
 
 		 499 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0503  band 7 protein  24.24 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00953758  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2882  band 7 protein  27.27 
 
 		 587 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.107759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3146  band 7 protein  26.78 
 
 		 585 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0682  band 7 protein  26.68 
 
 		 568 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0118281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4814  hypothetical protein  28.48 
 
 		 964 aa  66.6  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2218  hypothetical protein  24.01 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0348  band 7 protein  24.43 
 
 		 542 aa  64.3  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2091  band 7 protein  20.66 
 
 		 516 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0367  hypothetical protein  24.02 
 
 		 499 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4040  band 7 protein  24.47 
 
 		 693 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.725913 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0347  band 7 protein  27.35 
 
 		 254 aa  57  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>