103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0367 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0367  hypothetical protein  100 
 
 
499 aa  976    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0712  band 7 protein  62.45 
 
 
496 aa  533  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.350479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8817  band 7 protein  60.48 
 
 
518 aa  531  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.209913  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1073  band 7 protein  48.12 
 
 
477 aa  340  5e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.532983  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1761  band 7 protein  47.77 
 
 
480 aa  335  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000813907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8346  band 7 protein  44.78 
 
 
383 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2091  band 7 protein  33.47 
 
 
516 aa  202  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648722 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  34.12 
 
 
507 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  34.96 
 
 
507 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0503  band 7 protein  37.57 
 
 
370 aa  196  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00953758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  34.61 
 
 
519 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3314  band 7 protein  29.37 
 
 
495 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018778  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1912  band 7 protein  33.2 
 
 
492 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.76 
 
 
524 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.76 
 
 
526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  33.76 
 
 
524 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  33.76 
 
 
524 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.76 
 
 
526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  33.76 
 
 
524 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  33.76 
 
 
526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  33.55 
 
 
524 aa  174  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1402  flotillin  30.53 
 
 
489 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0725365  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5091  band 7 protein  33.26 
 
 
459 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000550559 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  32.91 
 
 
524 aa  170  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2104  band 7 protein  35.43 
 
 
513 aa  169  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  33.12 
 
 
524 aa  170  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  34.9 
 
 
482 aa  169  9e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  31.53 
 
 
537 aa  167  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  31.24 
 
 
509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0132  band 7 protein  33.4 
 
 
491 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01370  hypothetical protein  35.79 
 
 
490 aa  160  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  29.74 
 
 
475 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0782  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  33.33 
 
 
503 aa  144  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28446  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0812  band 7 protein  24.8 
 
 
468 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2499  Band 7 protein  28.05 
 
 
446 aa  113  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0504738  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0945  band 7 protein  24.84 
 
 
451 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  28.49 
 
 
477 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0402  band 7 protein  29.19 
 
 
473 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2287  band 7 protein  29.61 
 
 
467 aa  103  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0946  band 7 protein  27.18 
 
 
430 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0314  band 7 protein  29.9 
 
 
460 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05180  hypothetical protein  29.48 
 
 
499 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0445  band 7 protein  27.17 
 
 
538 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116716  normal  0.17273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1727  band 7 protein  32.3 
 
 
472 aa  99.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000752152  normal  0.0958573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2921  band 7 protein  28.03 
 
 
421 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3175  band 7 protein  28.03 
 
 
421 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0403  band 7 protein  28.57 
 
 
430 aa  97.8  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0313  band 7 protein  26.14 
 
 
423 aa  97.1  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1397  Band 7 protein  28.51 
 
 
447 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.936063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1398  Band 7 protein  27.88 
 
 
422 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267003  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  29.09 
 
 
500 aa  90.1  8e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2920  band 7 protein  25.39 
 
 
450 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3176  band 7 protein  25.39 
 
 
450 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.689378 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2498  Band 7 protein  27.69 
 
 
414 aa  88.2  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.115439  hitchhiker  0.00327007 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  27.27 
 
 
519 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  25.86 
 
 
507 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1144  band 7 protein  23.88 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.401105  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  27.17 
 
 
504 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2459  band 7 protein  24.53 
 
 
601 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3650  band 7 protein  24.53 
 
 
601 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00649439  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1938  band 7 protein  25.1 
 
 
381 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5721  band 7 protein  40 
 
 
681 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0977085  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0504  band 7 protein  27.04 
 
 
361 aa  56.2  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  24.1 
 
 
553 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2833  putative secreted protein  43.64 
 
 
748 aa  53.5  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  22.82 
 
 
305 aa  51.6  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  22.82 
 
 
305 aa  51.6  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1084  band 7 protein  22.27 
 
 
604 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  24.18 
 
 
553 aa  52  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.9 
 
 
553 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1616  SPFH domain-containing protein  24.77 
 
 
477 aa  50.8  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  23.9 
 
 
549 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  23.9 
 
 
553 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.69 
 
 
553 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  23.9 
 
 
553 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2218  hypothetical protein  23.13 
 
 
558 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  23.74 
 
 
542 aa  49.3  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1643  band 7 protein  24.7 
 
 
256 aa  48.5  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182156  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  24.88 
 
 
310 aa  48.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0682  band 7 protein  24.65 
 
 
568 aa  47  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0118281 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0946  band 7 protein  22.44 
 
 
595 aa  47  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  23.27 
 
 
327 aa  47  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2091  band 7 protein  23.24 
 
 
401 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0259831  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1572  band 7 protein  25.95 
 
 
307 aa  46.6  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  39.58 
 
 
312 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  24.32 
 
 
403 aa  45.8  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06503  protease  34.24 
 
 
695 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0317  band 7 protein  32.14 
 
 
646 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  21.38 
 
 
456 aa  45.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0260  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.25 
 
 
286 aa  44.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.55 
 
 
309 aa  44.3  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3554  inner membrane protein YqiK  24.67 
 
 
559 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0139  band 7 protein  23.33 
 
 
289 aa  44.3  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.889576  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  26.91 
 
 
562 aa  43.9  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0323  band 7 protein  25 
 
 
250 aa  43.9  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  23.5 
 
 
386 aa  43.9  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4837  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.19 
 
 
325 aa  43.5  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  24.67 
 
 
559 aa  43.9  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  24.67 
 
 
559 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  24.67 
 
 
559 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>