84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2218 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2218  hypothetical protein  100 
 
 		 558 aa  1095    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  59.96 
 
 		 553 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  60.19 
 
 		 553 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  60.11 
 
 		 553 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  60.11 
 
 		 549 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  60.11 
 
 		 553 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  60.37 
 
 		 553 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  60.67 
 
 		 542 aa  597  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  59.93 
 
 		 553 aa  587  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3554  inner membrane protein YqiK  59.27 
 
 		 559 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  59.09 
 
 		 559 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3388  inner membrane protein YqiK  59.09 
 
 		 559 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  58.91 
 
 		 559 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  58.91 
 
 		 559 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3022  band 7 protein  51.95 
 
 		 570 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2816  band 7 protein  47.18 
 
 		 592 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2899  band 7 protein  46.93 
 
 		 592 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3252  band 7 protein  46.93 
 
 		 592 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3109  band 7 protein  46.93 
 
 		 592 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2996  band 7 protein  46.93 
 
 		 592 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0005  band 7 protein  50.95 
 
 		 569 aa  458  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0238234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1267  band 7 protein  46.93 
 
 		 592 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1377  hypothetical protein  46.32 
 
 		 592 aa  455  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  46.93 
 
 		 592 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1084  band 7 protein  46.88 
 
 		 604 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1186  band 7 protein  46.68 
 
 		 590 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0804  hypothetical protein  47.29 
 
 		 585 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3622  band 7 protein  45.68 
 
 		 587 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0946  band 7 protein  46.88 
 
 		 595 aa  432  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01973  band 7 protein  45.5 
 
 		 589 aa  430  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0247971  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3146  band 7 protein  44.88 
 
 		 585 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  43.69 
 
 		 562 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2882  band 7 protein  44.3 
 
 		 587 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.107759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0682  band 7 protein  43.84 
 
 		 568 aa  371  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0118281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1794  band 7 protein  41.92 
 
 		 560 aa  355  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511769  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4673  band 7 protein  40.26 
 
 		 560 aa  303  4.0000000000000003e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.122447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4814  hypothetical protein  42.38 
 
 		 964 aa  267  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0348  band 7 protein  32.38 
 
 		 542 aa  219  8.999999999999998e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0265  band 7 protein  32.75 
 
 		 672 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00194603  normal  0.0128857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1413  band 7 protein  32.08 
 
 		 744 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4040  band 7 protein  31.51 
 
 		 693 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.725913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3820  band 7 protein  29.65 
 
 		 691 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22984  normal  0.142828 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3477  hypothetical protein  30.16 
 
 		 644 aa  156  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3315  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16180  hypothetical protein  29.87 
 
 		 688 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1390  hypothetical protein  29.62 
 
 		 688 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3700  hypothetical protein  28.36 
 
 		 667 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3387  hypothetical protein  26.42 
 
 		 681 aa  140  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2848  hypothetical protein  28.84 
 
 		 672 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6805  hypothetical protein  27.33 
 
 		 668 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2833  putative secreted protein  29.41 
 
 		 748 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1586  hypothetical protein  27.78 
 
 		 712 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5460  band 7 protein  28.28 
 
 		 679 aa  124  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal  0.831965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4688  band 7 protein  26.56 
 
 		 700 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2459  band 7 protein  26.82 
 
 		 601 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3650  band 7 protein  26.82 
 
 		 601 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00649439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06503  protease  27.53 
 
 		 695 aa  100  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  25.1 
 
 		 475 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  27.63 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  26.33 
 
 		 519 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25 
 
 		 526 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  25 
 
 		 524 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25 
 
 		 526 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25 
 
 		 524 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  25 
 
 		 524 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  25 
 
 		 524 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  25 
 
 		 524 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  25 
 
 		 526 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3314  band 7 protein  25.86 
 
 		 495 aa  73.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018778  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  26.94 
 
 		 507 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  25.64 
 
 		 524 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  23.78 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  25 
 
 		 524 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  26.11 
 
 		 507 aa  67.4  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  24.95 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  24.79 
 
 		 509 aa  62.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  23.51 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0132  band 7 protein  26.76 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01370  hypothetical protein  24.03 
 
 		 490 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  23.86 
 
 		 519 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  23.56 
 
 		 500 aa  55.5  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  23.17 
 
 		 537 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2287  band 7 protein  24.74 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338349  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1727  band 7 protein  24.02 
 
 		 472 aa  45.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000752152  normal  0.0958573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5091  band 7 protein  24.07 
 
 		 459 aa  43.9  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000550559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>