69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0503 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0503  band 7 protein  100 
 
 		 370 aa  742    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00953758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8346  band 7 protein  55.71 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8817  band 7 protein  42.38 
 
 		 518 aa  215  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.209913  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0712  band 7 protein  40.91 
 
 		 496 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.350479 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1073  band 7 protein  32.65 
 
 		 477 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.532983  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1761  band 7 protein  33.79 
 
 		 480 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000813907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0367  hypothetical protein  37.57 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2091  band 7 protein  37.23 
 
 		 516 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648722 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  33.33 
 
 		 507 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  33.6 
 
 		 507 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5091  band 7 protein  37.25 
 
 		 459 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000550559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3314  band 7 protein  31.15 
 
 		 495 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018778  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  33.44 
 
 		 537 aa  132  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01370  hypothetical protein  30.05 
 
 		 490 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1912  band 7 protein  33.56 
 
 		 492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  33.21 
 
 		 482 aa  119  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  30.38 
 
 		 524 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  30.38 
 
 		 524 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  30.38 
 
 		 526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  30.38 
 
 		 524 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.38 
 
 		 524 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.38 
 
 		 526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  30.38 
 
 		 524 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  30.38 
 
 		 524 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.38 
 
 		 526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  30.06 
 
 		 519 aa  116  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2104  band 7 protein  37.33 
 
 		 513 aa  116  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  30.38 
 
 		 524 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  32.42 
 
 		 477 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0132  band 7 protein  36.16 
 
 		 491 aa  112  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1402  flotillin  24.94 
 
 		 489 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0725365  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  30.45 
 
 		 509 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2287  band 7 protein  28.06 
 
 		 467 aa  106  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338349  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0782  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  30.13 
 
 		 503 aa  100  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28446  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  26.19 
 
 		 475 aa  100  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05180  hypothetical protein  28.57 
 
 		 499 aa  97.4  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0313  band 7 protein  25.88 
 
 		 423 aa  97.1  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0812  band 7 protein  28.23 
 
 		 468 aa  96.3  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2921  band 7 protein  27.05 
 
 		 421 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3175  band 7 protein  27.05 
 
 		 421 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1727  band 7 protein  30.26 
 
 		 472 aa  93.2  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000752152  normal  0.0958573 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0314  band 7 protein  26.56 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0946  band 7 protein  27.59 
 
 		 430 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1398  Band 7 protein  25.53 
 
 		 422 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0402  band 7 protein  24.93 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2498  Band 7 protein  26.26 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.115439  hitchhiker  0.00327007 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0445  band 7 protein  27.57 
 
 		 538 aa  79.7  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116716  normal  0.17273 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0403  band 7 protein  27.52 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1397  Band 7 protein  25.41 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.936063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0945  band 7 protein  24.63 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  26.32 
 
 		 500 aa  72.8  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3176  band 7 protein  23.89 
 
 		 450 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.689378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2920  band 7 protein  23.89 
 
 		 450 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2499  Band 7 protein  23.22 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0504738  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  24.24 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  26.05 
 
 		 504 aa  63.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  24.56 
 
 		 519 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1144  band 7 protein  23.32 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.401105  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.27 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06177  flotillin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G08180)  20.7 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.226938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  23.81 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.81 
 
 		 259 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  23.28 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  23.81 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  23.81 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0502  band 7 protein  22.58 
 
 		 363 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0005  band 7 protein  24 
 
 		 569 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0238234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  28.65 
 
 		 252 aa  43.9  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1413  band 7 protein  20.95 
 
 		 744 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>