75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05180 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_05180  hypothetical protein  100 
 
 
499 aa  969    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2091  band 7 protein  30.73 
 
 
516 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648722 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  31.48 
 
 
482 aa  156  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8817  band 7 protein  27.68 
 
 
518 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.209913  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2104  band 7 protein  31.76 
 
 
513 aa  146  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0712  band 7 protein  31.69 
 
 
496 aa  143  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.350479 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  28.48 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01370  hypothetical protein  30.56 
 
 
490 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1912  band 7 protein  32.62 
 
 
492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0132  band 7 protein  32.65 
 
 
491 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5091  band 7 protein  31.68 
 
 
459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000550559 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1073  band 7 protein  27.83 
 
 
477 aa  136  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.532983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  29.25 
 
 
507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3314  band 7 protein  28.29 
 
 
495 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018778  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0812  band 7 protein  28.3 
 
 
468 aa  130  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  28.73 
 
 
507 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0367  hypothetical protein  28.96 
 
 
499 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1761  band 7 protein  28.17 
 
 
480 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000813907 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  26.62 
 
 
519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  27.98 
 
 
537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  24.22 
 
 
524 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  26 
 
 
524 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  26 
 
 
526 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26 
 
 
524 aa  114  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26 
 
 
526 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26 
 
 
526 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  26 
 
 
524 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  24.32 
 
 
524 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  26 
 
 
524 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0314  band 7 protein  28.99 
 
 
460 aa  113  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  26 
 
 
524 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0503  band 7 protein  30.38 
 
 
370 aa  110  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00953758  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1402  flotillin  25.9 
 
 
489 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0725365  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2499  Band 7 protein  29.82 
 
 
446 aa  102  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0504738  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0402  band 7 protein  28.19 
 
 
473 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  27.35 
 
 
509 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0945  band 7 protein  26.09 
 
 
451 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1397  Band 7 protein  31.46 
 
 
447 aa  97.1  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.936063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  32.05 
 
 
477 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3176  band 7 protein  26.52 
 
 
450 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.689378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2920  band 7 protein  26.52 
 
 
450 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1144  band 7 protein  28.34 
 
 
473 aa  90.5  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.401105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8346  band 7 protein  27.48 
 
 
383 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0403  band 7 protein  27.92 
 
 
430 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0946  band 7 protein  30.05 
 
 
430 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0313  band 7 protein  23.33 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2921  band 7 protein  25.3 
 
 
421 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3175  band 7 protein  25.3 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2287  band 7 protein  29.09 
 
 
467 aa  84.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  28.5 
 
 
519 aa  84  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0782  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  26.59 
 
 
503 aa  80.1  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28446  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0445  band 7 protein  28.8 
 
 
538 aa  79  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116716  normal  0.17273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  25.46 
 
 
507 aa  77.8  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1398  Band 7 protein  26.36 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267003  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  30.05 
 
 
504 aa  74.3  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1727  band 7 protein  28.8 
 
 
472 aa  73.6  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000752152  normal  0.0958573 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2498  Band 7 protein  28.33 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.115439  hitchhiker  0.00327007 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  27.99 
 
 
500 aa  65.9  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1413  band 7 protein  25.75 
 
 
744 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3109  band 7 protein  23.53 
 
 
592 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  23.53 
 
 
592 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3252  band 7 protein  23.53 
 
 
592 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1267  band 7 protein  23.53 
 
 
592 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1084  band 7 protein  26.57 
 
 
604 aa  50.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0804  hypothetical protein  24.66 
 
 
585 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1186  band 7 protein  24.57 
 
 
590 aa  47.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0946  band 7 protein  24.68 
 
 
595 aa  47  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1377  hypothetical protein  24.23 
 
 
592 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01973  band 7 protein  23.88 
 
 
589 aa  45.8  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0247971  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3622  band 7 protein  22.71 
 
 
587 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2816  band 7 protein  24.23 
 
 
592 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2899  band 7 protein  24.23 
 
 
592 aa  43.9  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  35.44 
 
 
308 aa  43.1  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  35.44 
 
 
295 aa  43.5  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  35.44 
 
 
308 aa  43.1  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>